基因芯片发现帕金森症相关的新基因

　　

生物通报道：最近，科学家利用来自18,000多名患者的数据，发现了20多个帕金森病相关的遗传风险因子，包括6个以前没有报道过的。相关研究结果发表在2014年7月27日的《Nature Genetics》，该研究部分由美国国立卫生研究院（NIH）资助，在NIH实验室内完成。

本文资深作者、NIH国家老龄化研究所（NIA）的科学家Andrew Singleton博士指出：“解开帕金森病的遗传学基础，对于了解这种复杂疾病相关的多种机制极为重要，有望有一天会带来更有效的治疗方法。”

Singleton博士及其同事收集并结合来自现有全基因组关联研究（GWAS）的数据，这些数据可让科学家们能够在一大群人的遗传密码中，发现常见的变异或细微的差异。合并后的数据中包含了大约13,708例帕金森病病例和95,282例对照组，他们都是欧洲血统。

研究人员确定了潜在的遗传风险变异，它们可增加一个人患帕金森病的机会。这些研究结果表明，在某些情况下，一个人携带的变异越多，患病风险就越大，可达3倍高。

国家神经疾病和中风研究所的项目主任Margaret Sutherland博士称：“该研究汇集了一个大型国际研究团队，他们来自于公共和私人机构，对共享数据以加速帕金森病遗传风险因子的发现很感兴趣。这种合作方式的优势在于，所发现的通路和基因网络，可显著提高我们对帕金森病的理解。”

为了获得数据，研究人员与多个公共和私人机构合作，包括美国国防部、Michael J. Fox基金、23andMe和许多国际研究人员。

帕金森病影响全球约数百万人，是一种退行性疾病，会引起运动问题，包括手、臂或腿的颤抖，四肢和躯干的僵硬，行动迟缓和姿势问题。随着时间的推移，患者可能行走、说话困难，或者不能完成其他简单的任务。虽然已经有9个基因被证明可导致帕金森病的罕见形式，但科学家们继续寻找遗传风险因子，为这种疾病提供一个完整的遗传图。

研究人员在另一组受试者群组（包括5353名患者和5551名对照者）证实了这个结果。通过将这些遗传区域与一种国家最先进的基因芯片（称为NeuroX）上的序列进行比较，研究人员证实，24个变异代表帕金森病的遗传风险因子，包括以前没有发现过的6个变异。NeuroX基因芯片包含大约24000个常见基因变异，研究人员认为这些变异与多种神经退行性疾病相关。

Sutherland博士称：“这项研究的复制阶段，演示了NeuroX芯片解开神经退行性疾病秘密的效用。这些高科技、数据驱动基因组方法的力量，可让科学家们大海捞针，最终有望带来新的治疗方法。”

医学新发现的遗传风险因素，被认为与高歇氏病有关，调节炎症和神经细胞的化学信使多巴胺以及α-突触核蛋白，该蛋白已被证明在一些帕金森病患者大脑中积累。还需要进一步的研究来确定这项研究中所发现的变异的作用。

（生物通：王英）

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生物通推荐原文摘要：
Large-scale meta-analysis of genome-wide association data identifies six new risk loci for Parkinson's disease
Abstrac: We conducted a meta-analysis of Parkinson's disease genome-wide association studies using a common set of 7,893,274 variants across 13,708 cases and 95,282 controls. Twenty-six loci were identified as having genome-wide significant association; these and 6 additional previously reported loci were then tested in an independent set of 5,353 cases and 5,551 controls. Of the 32 tested SNPs, 24 replicated, including 6 newly identified loci. Conditional analyses within loci showed that four loci, including GBA, GAK-DGKQ, SNCA and the HLA region, contain a secondary independent risk variant. In total, we identified and replicated 28 independent risk variants for Parkinson's disease across 24 loci. Although the effect of each individual locus was small, risk profile analysis showed substantial cumulative risk in a comparison of the highest and lowest quintiles of genetic risk (odds ratio (OR) = 3.31, 95% confidence interval (CI) = 2.55–4.30; P = 2 × 10−16). We also show six risk loci associated with proximal gene expression or DNA methylation.