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LRIG1基因改变可增加乳腺癌复发和死亡风险
【字体: 大 中 小 】 时间:2014年06月05日 来源:生物通
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根据2014年6月1日《Cancer Research》杂志发表的一项研究称,肿瘤中LRIG1基因拷贝数减少的早期乳腺癌患者,更有可能复发或死亡。
生物通报道:根据2014年6月1日《Cancer Research》杂志发表的一项研究称,肿瘤中LRIG1基因拷贝数减少的早期乳腺癌患者,更有可能复发或死亡。
美国亚利桑那大学癌症中心癌症预防和控制项目带头人、细胞和分子医学系副教授Patricia A. Thompson指出:“具有转移能力的肿瘤,其细胞有干细胞特性,能抵抗化疗,常常静静地位于肿瘤内,很可能是转移性扩散的来源。LRIG1是一种蛋白质,被认为可控制这些细胞的生长,并使它们安静不动。”
人类细胞的大多数基因有两个副本。某些基因拷贝数的增加或减少,都与一些疾病相关,包括癌症。
在被诊断为乳腺癌1期或2期的患者当中,与那些肿瘤没有LRIG1拷贝数缺失的患者相比,肿瘤具有LRIG1拷贝数缺失的患者,复发的可能性加倍,确诊5年内或更晚复发的可能性为2.39倍,死亡的可能性为1.55倍。通常,1期和2期乳腺癌被认为处于低复发风险。这些结果可以帮助临床医生确定,哪些患者出现复发的风险加大,并更仔细地监控他们。
Thompson称:“首先,我们发现,早期患者肿瘤中LRIG1基因拷贝数的缺失,与疾病复发、转移和死亡的较高风险有关。第二,我们观察到,其肿瘤具有LRIG1拷贝数增加的患者,一般具有更好的临床和病理特点。这表明,LRIG1拷贝数的增加,可能有助于降低这些患者的复发风险。”
Thompson及其同事,利用1985年和2000年间MD安德森癌症中心收治的971名1期或2期乳腺癌患者的肿瘤组织样本。该分析是由MD安德森癌症中心和贝勒医学院及瑞典优密欧大学的研究人员合作完成。
他们利用一种高分辨率的分子倒置探针阵列(Affymetrix Oncoscan molecular inversion probe arrays),具有300,000个探针,其中12个可检测LRIG1基因中的变化。Thompson称,这种技术最适合于长期保存的样本,这对该项目至关重要。
在971份样本中,有3.7%的样本中LRIG1拷贝数有所增加,8.9%的样本出现该基因拷贝数缺失。研究人员还发现,与管腔A和管腔B亚型乳腺癌(小于10%)相比,在三阴性乳腺癌(13.8%)和HER2-阳性乳腺癌(12.3%)中,LRIG1拷贝数缺失更为常见。
在黑人和西班牙裔妇女(分别为12.8%和12.2%)的样本中,LRIG1拷贝数缺失也比较普遍,与非西班牙裔白人女性(7.7%)相比,他们往往有较差的乳腺癌预后。
研究人员发现,LRIG1拷贝数缺失与疾病复发、远端转移和死亡,有着明显的关联。
接下来研究人员使用来自于合并的、公开可用的数据集的数据,产生了1576份样本来分析LRIG1改变,发现与中高表达相比,这个基因的低表达与增加的远端转移和死亡有关。
即使对影响复发和转移的已知因素进行调整后,这两项分析的结果也没有改变,因此研究人员得出结论,LRIG1拷贝数的改变,在低风险患者中是乳腺癌转移和死亡的一个独立危险因素。
Thompson称:“LRIG1表达为RNA或蛋白质的水平测量值,在临床上将更具相关性,我们希望能开发出这样一种试验。将LRIG1开发为一种肿瘤标记,将有助于我们开发出新的药物,杀死或沉默这些细胞,作为预防乳腺癌复发和转移的一种途径。我们将患者确定为高风险或低风险复发的能力,已经大大提高。”
(生物通:王英)
延伸阅读:乳腺癌如何“表达自己”
生物通推荐原文摘要:
Loss of LRIG1 Locus Increases Risk of Early and Late Relapse of Stage I/II Breast Cancer
Abstract: Gains and losses at chromosome 3p12-21 are common in breast tumors and associated with patient outcomes. We hypothesized that the LRIG1 gene at 3p14.1, whose product functions in ErbB-family member degradation, is a critical tumor modifier at this locus. We analyzed 971 stage I/II breast tumors using Affymetrix Oncoscan molecular inversion probe arrays that include 12 probes located within LRIG1. Copy number results were validated against gene expression data available in the public database. By partitioning the LRIG1 probes nearest exon 12/13, we confirm a breakpoint in the gene and show that gains and losses in the subregions differ by tumor and patient characteristics including race/ethnicity. In analyses adjusted for known prognostic factors, loss of LRIG1 was independently associated with risk of any relapse (HR, 1.90; 95% CI, 1.32–2.73), relapse ≥ 5 years (HR, 2.39; 95% CI, 1.31–4.36), and death (HR, 1.55; 95% CI, 1.11–2.16). Analyses of copy number across chromosome 3, as well as expression data from pooled, publicly available datasets, corroborated the hypothesis of an elevated and persistent risk among cases with loss of or low LRIG1. We concluded that loss/low expression of LRIG1 is an
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