Nature报道第三个大型蛋白质组项目

在2003年，也就是人类基因组计划（Human Genome Project）公布第一张人类基因组序列后的第三年，瑞典的一组研究人员发起了人类蛋白质图集（Human Protein Atlas，HPA）项目，这是一个大规模蛋白质研究项目，主要目的是绘制人体组织和细胞中表达基因编码的蛋白位置。

　　

——第一张完整人类蛋白质组草图花费了科学家们十多年的心血，在这一过程中，我们收获了技术和生物学两方面的新知。

生物通报道：在2003年，也就是人类基因组计划（Human Genome Project）公布第一张人类基因组序列（包含大约两万个基因）后的第三年，瑞典的一组研究人员发起了人类蛋白质图集（Human Protein Atlas，HPA）项目，这是一个大规模蛋白质研究项目，主要目的是绘制人体组织和细胞中表达基因编码的蛋白位置。

目前还很少有蛋白通过这种方式定位，来自斯德哥尔摩皇家理工学院的蛋白研究专家，HPA项目的首席研究员Mathias Uhlén表示。构建人类“蛋白质组”的系统详细图集意味着更深入细致的研究蛋白的功能，这包括分析膜蛋白——细胞内外的“摆渡”分子，探索“分泌组（secretome）”——健康细胞和疾病细胞中分泌的蛋白，并且解析基因突变的生理影响。同时这也将有助于药物研发，预测候选药物是否能与某种蛋白相互作用，或者产生副作用。

来自瑞典乌普萨拉大学的病理学家，HPA项目创始人之一Fredrik Pontén表示，HPA项目公布的初步图谱和数据已经取得了一些成绩，带来了不少惊喜。

比如说这些图谱表明有3500的基因编码蛋白具有某一组织类型，或一些组织特异性的，而且睾丸中含有这其中三分之一的蛋白，比其它组织都多。

今年十一月，这一研究小组计划上传其完成的第一个人类蛋白质组图谱，这一图谱包括将近150万张组织和细胞的高分辨率显微照片，以及80％的人类蛋白质数据。这些信息来自360人的46个人类细胞系和组织样本，其中包括144人的44个正常组织类型，以及216人的20种最常见的癌症类型。

“最令人感到兴奋的是这一研究的规模，”Pontén说。此外还有另一个项目：亚细胞蛋白图集（subcellular protein atlas，生物通译）也将在明年完成，这一项目将会定位细胞内的蛋白。

HPA并不是唯一的蛋白图谱计划，其它的还包括人类蛋白质组计划（Human Proteome Project），这一计划与HPA相关，但是采用的是不同研究策略，目前这一计划公布了最新的两项结果：两个研究组分别公布了人类蛋白质组第一张草图，其中一个分析了30种不同的组织类型，编撰了由84％所有预期编码蛋白的人体基因翻译得到的蛋白。另一个创新性的推出了一个搜索性公共数据库：ProteomicsDB，这一数据库公布了18,097个基因获得的蛋白，占目前预计人类蛋白总数（19,629）的92％。具体内容请见：

Nature重大成果：首张人体蛋白详细图谱

两篇Nature公布里程碑成果：人类蛋白质组草图

原文摘选：

Proteomics: An atlas of expression

The first draft of the complete human proteome has been more than a decade in the making. In the process, the effort has also delivered lessons about technology and biology.