Nature子刊：农科院、华大基因联手完成甘蓝基因组测序

　　

生物通报道：中国农业科学院油料作物研究所、中国农业科学院蔬菜花卉研究所、华大基因等多家研究机构的科学家们近日完成了对甘蓝基因组的测序，并将这种作物的基因组草图发表在五月二十三日的Nature Communications杂志上。文章的通讯作者是油料作物研究所的研究员刘胜毅（Shengyi Liu）。

多倍化（Polyploidization）为植物的适应性进化提供了大量的遗传变异。但迄今为止人们还不清楚，这种基因组加倍是如何推动物种分化的。

芸薹属植物（Brassica）是研究多倍体进化的一个理想模型，它属于十字花科，包含了多种重要的农业及园艺作物，例如白菜、甘蓝等等。

研究人员通过Illumina、Roche 454和Sanger测序，完成了甘蓝（Brassica oleracea）的基因组草图，并将其与之前测序的姊妹种——白菜（B. rapa）进行比较。研究显示，甘蓝的基因组加倍区域存在着大量的染色体重排和基因丢失事件，其转座元件大量扩增。在甘蓝和白菜的基因组中，特定通路的基因保留和基因表达存在差异，许多旁系同源和直系同源基因出现了选择性剪切。此外，研究还鉴定了与抗癌植物素生产和形态差异有关的基因，展现了基因组加倍和差异化的结果。（白菜基因组测序：中国农科院、华大基因联合发表Nature Genetics新文章）

白菜和甘蓝是我国主要的蔬菜作物，这项基因组研究不仅有助于人们进一步理解芸薹属的基因组进化，还为许多重要作物的研究提供了宝贵线索。解析芸薹属的基因组进化和分化过程，可以帮助人们更好地对相关蔬菜和油料作物进行育种。

作者简介：

刘胜毅，男，博士，研究员，博士生导师，油料所功能基因组学研究室主任，国家油菜产业技术体系功能研究室主任及岗位专家，中国农科院油料作物基因组学创新团队首席。1982.9-1986.7华中农业大学遗传育种专业，获得学士学位；1994.9-2000.07中国农科院研究生院植物病理专业，分别获得硕士和博士学位；1988年4月-11月在国际半干旱作物所进修，从事花生抗叶斑和锈病研究；2001.4-2004.2美国农业部研究中心访问研究员和英国Rothamsted Research高级博士后研究员。为湖北省跨世纪人才工程高层次人才和中国农业科学院基因组与基因工程二级岗位人才，国家油菜产业技术体系专家组成员，“十一五”科技部“863”“动植物功能基因组研究”重大项目总体专家组成员，华中农业大学和中南民族大学兼职教授，中国植物病理学会理事，中国油料作物专业委员会理事，湖北省植物病理学会副理事长。

长期从事于油菜菌核病抗病性及其防治技术研究和油料作物基因组学研究，研究方向包括：1）油菜菌核病抗病育种、抗病分子机制及综合防治技术研究；2）油菜配子发育分子解析和杂优利用新型授粉控制系统构建；3）比较基因组学、基因组进化与复杂性状形成机制研究。

 

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The Brassica oleracea genome reveals the asymmetrical evolution of polyploid genomes