浙大: 测序鉴定小白菜花粉发育阶段miRNAome

　　

花粉发育是开花植物生命周期的一个重要过程，也是影响农作物种子的产量和质量的主要因素。microRNAs（miRNAs）是有调节功能的内源性非编码小分子RNA，是植物生长过程中发育和应激反应过程中必不可少的。然而，目前对miRNA在开花植物有性生殖上的功能了解有限。为此，浙江大学曹家树教授领衔团队对参与花粉发育过程的miRNA做了深入探索*，成果发表在近期的BMC Genomics上。

研究人员首先构建两个独立小RNA文库，分别来自小白菜（Brassica campestris ssp. chinensis）雄性不育系（Bcajh97-01A）和雄性可育系（Bcajh97-01B）的花蕾，然后进行高通量测序分析。鉴定出了8个来自已知miRNA前体另一条臂上的新miRNA，54个新的保守miRNA以及8个新的miRNA。发现了25对新的miRNA/miRNA*。研究人员还发现在所有已确定的miRNA，18个差异表达的miRNA在Bcajh97-01A和Bcajh97-01B的花蕾之间有超过两倍的改变。qRT-PCR分析表明，大多数差异表达的miRNA在Bcajh97-01B的花蕾中优先表达。降解组测序分析表明，一共有7个miRNA的15个靶基因被鉴定出来（上述测序工作均由联川生物承担完成）。

上述发现综述了与花粉相关的潜在miRNA以及miRNA与它们靶基因的相互作用，这为探索miRNA在花粉发育过程中发挥的作用提供了重要的线索。

* Jiang J, Lv M, Liang Y, Ma Z, Cao J. Identification of novel and conserved miRNAs involved in pollen development in Brassica campestris ssp. chinensis by high-throughput sequencing and degradome analysis. (2014) BMC Genomics 15:146 [article]

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