PNAS：lncRNA可作为白血病预后标志物

最近，美国俄亥俄州立大学综合癌症中心- Arthur G. James肿瘤医院和Richard J. Solove研究所（OSUCCC - James）研究人员带领的一项新研究，描述了一种新的标志物，可能帮助医生为许多急性髓细胞白血病（AML）老年患者选择毒性最小、最有效的治疗方法。相关研究结果发表在最近的《PNAS》杂志。

　　

生物通报道：最近，美国俄亥俄州立大学综合癌症中心- Arthur G. James肿瘤医院和Richard J. Solove研究所（OSUCCC - James）研究人员带领的一项新研究，描述了一种新的标志物，可能帮助医生为许多急性髓细胞白血病（AML）老年患者选择毒性最小、最有效的治疗方法。AML好发于老年人，中位发病，年龄为65～70岁，35%新诊断的AML患者年龄≥75岁，三年的生存率为5%到15%。

研究人员研究了称为长非编码RNAs（lncRNAs）的分子的模式，这类RNA分子长度超过200个核苷酸单位，参与基因的调节。研究人员在60岁及以上患有细胞遗传学正常（CN）AML的老年患者中，检测了lncRNAs的丰度或表达。相关研究结果发表在最近的《PNAS》杂志。

本文第一作者、俄亥俄州立大学内科学副教授Ramiro Garzon博士指出：“我们已经确认了48个lncRNAs的模式，可预测老年CN-AML患者对标准化疗的反应和总生存率。”

他说：“在良好组中的患者，对标准化疗反应的概率较高，而在不利组中的患者，一般对治疗的反应不佳，具有较差的整体生存率。”

本研究首席研究员、俄亥俄州立大学特聘教授Clara D. Bloomfield博士说，这些结果非常重要，有几个原因。“首先，它们强烈表明，lncRNA表达谱可以预测哪些患者会对标准治疗有反应。这很重要，因为它可使患者免受实验性疗法的毒副作用。”

“被分在不利组中的患者，将接受不同的疗法，干细胞移植或用新治疗方法的一个临床试验。因此，本研究将帮助我们为每名患者定制白血病疗法。”此外，她说，这项研究为新疗法的开发确定了很多新靶点。

Garzon、Bloomfield及其同事们，利用来自Cancer and Leukemia Group B 临床试验的148名老年CN-AML患者的骨髓样本，开发了一种预后评分系统。所有患者都接受了相同的化疗方案。

研究人员首先确定了与预后最相关的48个lncRNAs。利用这48个lncRNAs，研究人员将患者分为两组：具有良好预后得分和具有不好预后得分的患者。然后，研究人员在71名接受同样治疗的CN-AML患者独立匹配组中，验证了预后得分。

将具有不利预后得分的患者与具有良好得分的患者进行对比，显示如下：
• 具有不利分得分的患者，具有较低的完全反应（CR）率（分别为54%和89%）；
• CR三年后，具有不利分得分的患者当中，只有7%的人完全摆脱了疾病，而具有良好分值的患者中，这个值是39%。
• 具有不利得分的这些患者，三年的总生存率是10%，而具有良好得分的患者为43%。
• 独特的lncRNA表达谱与6个临床上重要的CN-AML突变有关。

总而言之，研究人员发现，lncRNA表达谱与AML的复发性突变、临床特征和预后有关。这些lncRNAs的一部分，可能在白血病生成中起着功能性作用。此外，lncRNAs可以用作AML预后的生物标志物。

（生物通：王英）

延伸阅读：《相约2015NSFC》之疾病相关lncRNA研究策略

生物通推荐原文摘要：
Expression and prognostic impact of lncRNAs in acute myeloid leukemia
Abstract: Long noncoding RNAs (lncRNAs) are transcripts longer than 200 nucleotides, located within the intergenic stretches or overlapping antisense transcripts of protein coding genes. LncRNAs are involved in numerous biological roles including imprinting, epigenetic regulation, apoptosis, and cell cycle. To determine whether lncRNAs are associated with clinical features and recurrent mutations in older patients (aged ≥60 y) with cytogenetically normal (CN) acute myeloid leukemia (AML), we evaluated lncRNA expression in 148 untreated older CN-AML cases using a custom microarray platform. An independent set of 71 untreated older patients with CN-AML was used to validate the outcome scores using RNA sequencing. Distinctive lncRNA profiles were found associated with selected mutations, such as internal tandem duplications in the FLT3 gene (FLT3-ITD) and mutations in the NPM1, CEBPA, IDH2, ASXL1, and RUNX1 genes. Using the lncRNAs most associated with event-free survival in a training cohort of 148 older patients with CN-AML, we derived a lncRNA score composed of 48 lncRNAs. Patients with an unfavorable compared with favorable lncRNA score had a lower complete response (CR) rate [P < 0.001, odds ratio = 0.14, 54% vs. 89%], shorter disease-free survival (DFS) [P < 0.001, hazard ratio (HR) = 2.88] and overall survival (OS) (P < 0.001, HR = 2.95). The validation set analyses confirmed these results (CR, P = 0.03; DFS, P = 0.009; OS, P = 0.009). Multivariable analyses for CR, DFS, and OS identified the lncRNA score as an independent marker for outcome. In conclusion, lncRNA expression in AML is closely associated with recurrent mutations. A small subset of lncRNAs is correlated strongly with treatment response and survival.