Nature Biotechnology公布雪貂基因组草图

　　

生物通报道：Nature Biotechnology杂志近日公布了雪貂的基因组草图，这是流感、囊性纤维化等疾病研究中的一个重要进展。研究人员利用这一基因组序列，在细胞水平上分析了流感和囊性纤维化对呼吸道组织的影响。领导这项研究的是华盛顿大学的Michael Katze和Xinxia Peng，以及Broad研究所的Federica Di Palma和Jessica Alfoldi。

雪貂一直被认为是研究某些人类疾病的理想模型，尤其是流感。这是因为感染人类的流感病毒株同样能够感染雪貂，而且病毒在雪貂之间的传播类似于它们在人群中的传播。

研究人员测序并注释了一只宠物貂（Mustela putorius furo）的基因组，随后还进行了转录组分析。转录组是指给定时间所有得到转录的RNA，转录组分析可以了解雪貂细胞在流感和囊性纤维化中发生的变化。

“我们建立了高质量的雪貂基因组和转录组资源，”Federica Di Palma说。

研究人员用曾经造成流感大爆发的两个病毒株（1918年西班牙流感病毒株和2009年猪流感病毒株）处理雪貂，然后在感染后的第一天、第三天和第八天收集雪貂的气管和肺部样本进行转录组分析。

他们发现，两种病毒对雪貂的气管和肺部造成了不同的影响。举例来说，1918病毒株在感染第一天引发了气管的显著应答，这个应答持续到了感染的第八天。而2009病毒株引发的应答比较慢，这个应答在感染第八天达到顶峰。这两种病毒对肺部的影响与气管不同，不过两种病毒触发的肺部基因转录相差无几。这些发现将有助于人们进一步理解流感病毒的感染机制。（延伸阅读：Science：澄清H7N9的传播能力）

研究人员还构建了缺乏蛋白CFTR（cystic fibrosis transmembrane conductance regulator）的囊性纤维化雪貂模型，CFTR基因缺陷是这种遗传病的病因。这样的基因敲除模型，是研究基因缺失或缺陷型基因的常用途径。

囊性纤维化雪貂模型的转录组分析显示，疾病相关的基因表达变化在雪貂出生第一天就会出现，这种变化在随后15天显著增大。

“雪貂出生第一天就出现了转录水平的改变，而且许多改变与人类患者很相似，”Peng说。“这说明，囊性纤维化中造成肺部损伤的一些疾病过程出现得很早。”

研究人员指出，在流感和囊性纤维化研究中，雪貂的转录组应答与人类非常相似，它们的确可以成为研究人类疾病的理想模型。

 

生物通编辑：叶予

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