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SMARTer技术让单细胞研究更轻松[新品推荐]
【字体: 大 中 小 】 时间:2013年09月04日 来源:生物通
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Clontech公司(Takara旗下全资子公司)近日为Fluidigm的C1单细胞全自动制备系统推出了SMARTer Ultra Low RNA Kit。这款试剂盒完美契合Fluidigm C1平台,能够从C1捕获的单细胞中产生mRNA-seq文库,从而让单细胞的研究更加轻松。
生物通报道 Clontech公司(Takara旗下全资子公司)近日为Fluidigm的C1单细胞全自动制备系统推出了SMARTer Ultra Low RNA Kit。这款试剂盒完美契合Fluidigm C1平台,能够从C1捕获的单细胞中产生mRNA-seq文库,从而让单细胞的研究更加轻松。
两年前,Clontech曾推出适用于Illumina测序仪的文库制备试剂盒 – SMARTer Ultra Low RNA Kit for Illumina Sequencing。如今,这款SMARTer Ultra Low RNA Kit for the Fluidigm C1 System稍作改动,以满足C1平台的需求。试剂盒中包含了cDNA合成所需的全部组分,包括SMARTScribe逆转录酶和Advantage 2 PCR聚合酶。
此试剂盒利用SMARTer™技术来富集全长转录本,并维持原先mRNA转录本的真实再现,这对转录组测序和基因表达分析非常关键。它制备出的cDNA样品可在Illumina的Genome Analyzer、HiSeq或MiSeq测序仪上进行转录组分析。
SMART技术是Clontech的专利技术,2009年升级为SAMRTer技术后,采用更灵敏的SMARTer Oligo和高效的SMARTScribe RT进行逆转录,使其灵敏度提高至皮克级。利用SMARTer技术只需单管、单酶即可完成逆转录,无需接头连接,减少了样品操作步骤,也极大降低了样品损失,保留了原始信息,为RNA-Seq提供了可靠的基础。
据介绍,Fluidigm在C1平台上检验了多款试剂盒,发现SMARTer cDNA合成是最可靠的方法之一。不过,C1平台所需的试剂量与之前适用于Illumina测序仪的试剂盒有所不同。
为助力当今热门的RNA-seq研究,Clontech在不久前还推出了SMARTer Universal Low Input RNA Kit for Sequencing。这款试剂盒同样基于强大的SMARTer技术,采用随机引物进行逆转录,使低品质RNA的RNA-Seq分析成为可能。
对于生物学中常用的福尔马林固定、石蜡包埋(FFPE)组织和激光捕获显微切割(LCM)样品,其RNA往往降解,导致整体质量和产量不佳。此外,还有些RNA样品没有poly(A)尾巴,无法进行常规的cDNA合成。SMART操作大大减少了RNA样品的处理,从而最大限度避免了样品损失的风险,保留了原始信息。(生物通 余亮)