BMC Genomics：解析麦瘿蚊microRNA组

　　

瘿蚊，是一类具有经济重要性的昆虫，并包含着迷人的生物学特性。瘿蚊中许多种类的幼虫是在植物体上成长的，在它们成长的过程中往往会使植物生病形成一个像瘤子样的大包，称为虫瘿。瘿蚊中的黑森瘿蚊，俗称麦瘿蚊，是一种小麦害虫，并且是研究瘿蚊的生物学和昆虫–植物宿主相互作用的模式生物。

MicroRNAs（miRNAs）是一类非编码小RNA，对基因表达的转录后水平调节中发挥重要作用。最近，美国堪萨斯州立大学的研究人员，对麦瘿蚊中的miRNA进行了研究*，研究成果发表在近期的BMC Genomics 上。

研究人员先对一个麦瘿蚊的幼虫miRNA组进行深度测序（小RNA测序服务由联川生物提供），结果发现184个在其他物种中尚未见报道的新的miRNA。 基于序列相似性及miRNA前体的茎环结构存在，研究人员接着对麦瘿蚊基因组序列进行全基因组搜索，一共获得了611个miRNA编码基因。对这611个假定基因进行分析，揭示了一个显著的特征：一些miRNA基因家族急剧扩张。最大的家族包含91个基因，编码20种不同的miRNAs。定制微阵列分析显示，在麦瘿蚊幼虫的发育过程中，miRNA基因的表达受到严格控制，许多miRNA基因的丰度受到宿主基因型的影响（miRNA定制芯片服务由联川生物提供）。

本研究首次从瘿蚊中识别出大量miRNA，为进一步对瘿蚊的生物学和行为研究提供了基础。相同或相似miRNA戏剧性扩张提供了一个独特的系统来研究miRNA iso-gene，序列特异性变化（因miRNAs的小变化引起）以及mRNA靶基因变化之间的功能关联。该研究成果将有助于识别miRNA基因利用转基因技术进行害虫防治。

*Khajuria C, Williams CE, Bouhssini ME, Whitworth RJ, Richards S, Stuart JJ, Chen M. (2013) Deep sequencing and genome-wide analysis reveals the expansion of MicroRNA genes in the gall midge Mayetiola destructor. BMC Genomics 14(1), 187. [article]

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