Nature子刊:全基因组关联研究揭示常见眼病风险因子

【字体: 时间:2013年03月06日 来源:生物通

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  老年性黄斑变性AMD是老年人中的头号致盲因素,现在科学家们通过一项大型研究,在人类基因组中发现了与AMD有关的七个新位点。同时,他们还验证了此前人们所发现的十二个AMD有关位点。文章提前发表在Nature Genetics杂志的网络版上。

  

生物通报道:老年性黄斑变性AMD是老年人中的头号致盲因素,现在科学家们通过一项大型研究,在人类基因组中发现了与AMD有关的七个新位点。同时,他们还验证了此前人们所发现的十二个AMD有关位点。文章提前发表在Nature Genetics杂志的网络版上。

这项研究是迄今为止最广泛的AMD遗传学研究,旨在通过大量的全基因组分析寻找与AMD有关的基因突变。NIH下属的美国国家眼科研究所NEI为这项研究提供了资助。

“这项工作是一个巨大的进步,有助于我们理解AMD的发病机理,”Case Western Reserve大学医学院的Sudha Iyengar教授说。“老年性黄斑变性并不是由单个DNA突变引起的,而是患者一生中许多事件累积的结果。确定AMD的所有相关基因,将帮助我们了解AMD疾病进程的分子机制。”

AMD影响的是黄斑,黄斑是视网膜中负责中心视力的区域。视网膜是一层位于眼球后部的光敏组织,其上分布着视锥细胞和视杆细胞(感光细胞)。与视网膜其他区域相比,黄斑处的视锥细胞格外密集。在读书、驾驶和面部识别时,人类的敏锐视觉依赖黄斑实现。但AMD的发展,会使这些行为变得越来越困难,甚至无法完成。有些AMD可以治疗,但这种疾病是无法治愈的。在美国,约有两百万人患有AMD

2005年,人们发现补体因子H(一个免疫系统组分)基因上的特定突变与AMD 风险有关。自那以后,世界上许多研究团队就开始进行全基因组关联分析,以寻找影响AMD风险的其他遗传因素。这类研究得益于人类基因组计划和国际人类基因组单体型图计划(The International HapMap Project)等大型项目。国际人类基因组单体型图计划,旨在确定人类基因组中基因突变的普遍模式,解析人类遗传的相似性和差异性。

研究人员分析了超过17,100AMD患者的数据,并将其与60,000名非AMD患者进行比较。他们发现,与AMD有关的19个位点涉及了多种生物学功能,包括免疫系统调节,细胞结构维持,血管生长和渗透,脂质代谢,和动脉粥样硬化。

与二型糖尿病等其他常见病相同,个体患AMD的风险是由多个基因共同决定的。研究人员指出,对上述19个位点的周围区域进行综合分析,会发现一些对AMD风险影响较大的罕见基因。发现这样的基因,将极大推动科学家们对AMD发病机理的理解,帮助他们开发更有效的治疗方式。

“这项研究展示了国际合作的巨大价值,” 美国国家眼科研究所主管Paul A. Sieving博士说。“该研究结合了大量研究数据,揭示了AMD的分子基础。这将有助于进一步探索这种疾病的病因,开发更有效的新诊断和治疗策略。”

 

(生物体编辑:叶予)

生物通推荐原文摘要:

Seven new loci associated with age-related macular degeneration

Age-related macular degeneration (AMD) is a common cause of blindness in older individuals. To accelerate the understanding of AMD biology and help design new therapies, we executed a collaborative genome-wide association study, including >17,100 advanced AMD cases and >60,000 controls of European and Asian ancestry. We identified 19 loci associated at P < 5 × 10−8. These loci show enrichment for genes involved in the regulation of complement activity, lipid metabolism, extracellular matrix remodeling and angiogenesis. Our results include seven loci with associations reaching P < 5 × 10−8 for the first time, near the genes COL8A1-FILIP1L, IER3-DDR1, SLC16A8, TGFBR1, RAD51B, ADAMTS9 and B3GALTL. A genetic risk score combining SNP genotypes from all loci showed similar ability to distinguish cases and controls in all samples examined. Our findings provide new directions for biological, genetic and therapeutic studies of AMD.

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