Nature子刊：大型跨国研究解析卵巢癌

　　

生物通报道：Mayo诊所癌症中心的研究人员发现了一个新基因，该基因会使女性更容易患上卵巢癌。他们对超过16,000名卵巢癌患者和超过26,000名健康女性进行了大规模分析，并由此找到了这个被称为HNF1B的新基因。这项研究的结果发表在本期的Nature Communications杂志上。

这一成果得益于一项被称为COGS的大型跨国合作项目（Collaborative Oncological Gene-environment Study），该项目集合了来自欧洲、亚洲、澳大利亚和北美洲的多个研究团队。现在，该项目催生了十多篇文章，同时发表在Nature Communications、Nature Genetics等五种期刊上。这一系列标志性的文章，为人们提供了超过250,000名个体的基因分析结果，分析了与三种激素相关癌症有关的DNA序列，包括卵巢癌、乳腺癌和前列腺癌。

“在这个大型项目中，我们与多个研究团队合作，获取了宝贵的共享数据。这使我们能够进一步理解上述疾病中的遗传因素，”文章的资深作者，Mayo诊所的Ellen Goode博士说。该项目还产生了另外三篇与卵巢癌和乳腺癌有关的文章，Dr. Goode同时也是这些文章的共同作者之一。在美国，卵巢癌是妇科癌症中最常见的死因。

Dr. Goode及其同事在研究中发现，在不同卵巢上皮性癌亚型中，HNF1B的表达存在差异，而且这种差异与表观遗传学修饰有关。为了综合研究HNF1B基因突变与患病风险的关系，他们在不同亚型的卵巢癌中检测了该基因的突变，并分析了不同基因变体的甲基化和表达情况。

研究显示，HNF1B中的突变会影响该基因启动子的甲基化程度，从而产生不同的卵巢癌亚型。研究显示，DNA甲基化对基因表达的激活和抑制，在癌症中与基因突变同样重要。

“不同的甲基化模式，是该基因增加癌症风险的一个分子机制，”Dr. Goode说。“这一发现具有重要的临床意义，不仅增进了我们对发病机理的了解，还能够帮助我们更好的鉴别卵巢癌亚型，以及开发新的治疗途径。”

 

（生物通编辑：叶予）

生物通推荐原文摘要：

Epigenetic analysis leads to identification of HNF1B as a subtype-specific susceptibility gene for ovarian cancer

HNF1B is overexpressed in clear cell epithelial ovarian cancer, and we observed epigenetic silencing in serous epithelial ovarian cancer, leading us to hypothesize that variation in this gene differentially associates with epithelial ovarian cancer risk according to histological subtype. Here we comprehensively map variation in HNF1B with respect to epithelial ovarian cancer risk and analyse DNA methylation and expression profiles across histological subtypes. Different single-nucleotide polymorphisms associate with invasive serous (rs7405776 odds ratio (OR)=1.13, P=3.1 × 10−10) and clear cell (rs11651755 OR=0.77, P=1.6 × 10−8) epithelial ovarian cancer. Risk alleles for the serous subtype associate with higher HNF1B-promoter methylation in these tumours. Unmethylated, expressed HNF1B, primarily present in clear cell tumours, coincides with a CpG island methylator phenotype affecting numerous other promoters throughout the genome. Different variants in HNF1B associate with risk of serous and clear cell epithelial ovarian cancer; DNA methylation and expression patterns are also notably distinct between these subtypes. These findings underscore distinct mechanisms driving different epithelial ovarian cancer histological subtypes.