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BioTechniques:2013年蛋白质分析文章精选
【字体: 大 中 小 】 时间:2013年12月24日 来源:生物通
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生物通报道:蛋白质分析一直是生物学中的热点领域。日前,BioTechniques杂志对2013年的蛋白质分析文章进行了盘点,选出了三篇精选文章进行推荐,让我们一起来了解一下吧。
生物通报道:蛋白质分析一直是生物学中的热点领域。日前,BioTechniques杂志对2013年的蛋白质分析文章进行了盘点,选出了三篇精选文章进行推荐,让我们一起来了解一下吧。
1. A designed, phase changing RTX-based peptide for efficient bioseparations
在需要进行蛋白分离的时候,纯化往往是最麻烦的步骤。色谱分析法成本最高也最耗费时间,为此,人们开发出了分离蛋白的替代方法,如刺激-应答型标签。在适当的刺激条件下,刺激-应答型标签能实现可逆的蛋白沉淀。这是一种有效的方法,不过这种技术往往需要改变温度或者用特定缓冲液来诱导沉淀。
今年四月,哥伦比亚大学的Scott Banta及其同事发表文章,提出了一个简洁的新型刺激-应答型标签。他们以天然RTX结构域为基础,构建了合成多肽,能够实现温和的钙应答。这种技术的沉淀条件很温和,用蛋白酶切掉标签后,可以获得有活性的纯蛋白。这一技术不仅成本低而且速度快,非常适用于日常研究。
对哺乳动物蛋白进行免疫印迹(Western blot)定量时用的内参,不适合其他生物,例如盘基网柄菌(Dictyostelium discoideum)。举例来说,在盘基网柄菌的发育过程中,Actin水平变化很大。Davidson等人七月发表的文章解决了这一问题,他们在盘基网柄菌的WB实验中,利用标记的链霉亲和素,检测生物素化的线粒体MCCC1(3-methylcrotonyl-CoA carboxylase α)。研究显示,这是一个有效且方便的标准化工具,可以为许多蛋白分析研究提供帮助。
3. A rapid and efficient method to purify proteins at replication forks under native conditions
研究复制叉处的蛋白动力学,对于理解DNA的复制和修复非常重要。iPOND (Isolation of Protein On Nascent DNA)是一种捕获复制叉蛋白的重要方法。多伦多大学的Rob Bremner及其同事于今年十月发表文章,提出了能够增加蛋白产量的简化方案aniPOND,进一步推动了蛋白捕获技术的发展。简化方案将细胞膜裂解与胞核收集结合为一步,这样可以减少洗脱步骤,降低样本的损失。aniPOND还采用了更为温和的细胞核裂解方案,来保护DNA-蛋白复合体。研究显示,aniPOND比iPOND更快,还避免了甲醛交联,能够提升蛋白的产量。这样的技术能帮助人们进一步理解,DNA复制和复制叉处的蛋白装配。
(生物通编辑:叶予)
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