上海交大****Nature子刊发表测序新成果

【字体: 时间:2013年12月12日 来源:生物通

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  来自上海交通大学医学院、华大基因研究院的研究人员,通过对胰岛素瘤进行全外显子组测序鉴别出了YY1基因T372R频发突变,这一研究成果在线发表在12月10日的《自然通讯》(Nature Communications)杂志上。

  

生物通报道  来自上海交通大学医学院、华大基因研究院的研究人员,通过对胰岛素瘤进行全外显子组测序鉴别出了YY1基因T372R频发突变,这一研究成果在线发表在12月10日的《自然通讯》(Nature Communications)杂志上。

领导这一研究的是上海交通大学医学院附属瑞金医院副院长、长江特聘教授宁光(Guang Ning),其主要研究方向是代谢综合征的临床及基础研究;遗传性内分泌病的诊断和治疗。

胰岛素瘤(insulinoma)又称胰岛β-细胞瘤,是常见的胰腺内分泌肿瘤,这一疾病在临床上主要以分泌大量胰岛素而引起发作性低血糖症候群为特征,是器质性低血糖症中较常见的病因。本病约90%以上为胰岛B细胞的良性肿瘤,且约90%为散发。由于无有效的预防措施,早发现早诊断是胰岛素瘤防治的关键。通过揭示导致胰岛素瘤发生的个人遗传因素,对于早期检测诊断,以及寻找治疗的潜在靶点无疑具有重要的意义。

外显子(exon)是真核生物基因的一部分,包含着合成蛋白质所需要的信息。人类基因组大约含有18万个外显子(约30Mb),占人类基因组1%。全部外显子,称为“外显子组”(Exome)。

外显子组测序 (Exome sequencing)是近年发展起来的一种利用序列捕获技术将全基因组外显子区域DNA捕捉并富集后进行高通量测序的基因组分析方法。由于外显子组测序只需针对外显子区域的DNA即可(目前由DNA变异引起的疾病估计有85%以上来自于外显子组区域的变异),因此远比进行全基因组序列测序更简便、经济、高效,其目标区域覆盖度也更高,便于变异检测。

目前,外显子测序已经在米勒综合症、歌舞伎综合症、重型颅脑畸形等孟德尔疾病的研究中得到成功应用。还有其它一些癌症和复杂性疾病也应用外显子测序观察到高度相关的突变。

在这篇新文章中,研究人员通过对10个散发性胰岛素瘤进行全外显子组测序,鉴别出了YY1基因的T372R频发体细胞突变。在另外103个胰岛素瘤中进行进一步筛查,揭示了这一热点突变存在于30% (34/113)的肿瘤中。在胰岛素瘤中T372R突变改变了YY1靶基因的表达。研究人员证实,在临床上T372R突变与较晚发病有关。对YY1进行基因分型或许有助于胰岛素瘤的治疗。

这些研究结果表明了YY1在胰腺β细胞中发挥着重要的作用,并为胰岛素瘤提供了一个潜在的治疗靶点。

(生物通:何嫱)

生物通推荐原文摘要:

Whole exome sequencing of insulinoma reveals recurrent T372R mutations in YY1

Functional pancreatic neuroendocrine tumours (PNETs) are mainly represented by insulinoma, which secrete insulin independent of glucose and cause hypoglycaemia. The major genetic alterations in sporadic insulinomas are still unknown. Here we identify recurrent somatic T372R mutations in YY1 by whole exome sequencing of 10 sporadic insulinomas. Further screening in 103 additional insulinomas reveals this hotspot mutation in 30% (34/113) of all tumours. T372R mutation alters the expression of YY1 target genes in insulinomas. Clinically, the T372R mutation is associated with the later onset of tumours. Genotyping of YY1, a target of mTOR inhibitors, may contribute to medical treatment of insulinomas. Our findings highlight the importance of YY1 in pancreatic β-cells and may provide therapeutic targets for PNETs.

作者简介:

宁光

男,1963年6月出生,博士,教授、博士生导师。现为上海交通大学医学院附属瑞金医院副院长、上海市内分泌研究所所长、内分泌代谢科主任、上海市内分泌代谢病临床医学中心主任和上海市内分泌肿瘤重点实验室主任。兼任中华医学会内分泌分会主委、国际内分泌学会执委会委员、中华内分泌代谢杂志副总编、Journal of Diabetes联合主编。

先后承担各级基金30余项,作为第一完成人曾获国家科技进步奖2等奖、上海市科技进步1等奖、主编专著3部。曾获银蛇奖、曙光学者、科技启明星、优秀学科带头人、国务院特殊津贴获得者、教育部优秀骨干教师、上海市领军人才等。

头衔:****特聘教授、国家八部委新世纪百千万工程国家级人才、国家杰出青年基金获得者。

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