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现场交流:第三代单分子测序 PacBio技术及其应用进展讲座
【字体: 大 中 小 】 时间:2012年03月30日 来源:生物通
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第三代测序究竟有多好?PacBio RS系统还有哪些新应用?让我们当面问问专家吧。基因有限公司特邀Pacific Biosciences技术专家在4月5日下午上海好望角大饭店举办“第三代测序技术—PacBio单分子测序技术及其应用进展”技术交流会,介绍最新技术,交流最新进展。机会难得,欢迎各位专家、老师、同学前往。
Pacific Biosciences 公司第三代单分子实时测序系统PacBio RS新版C2试剂在今年2月成功推出,片段平均读长从过去的1300bp提升至3000bp,而数据量也提高了3-4倍。
与此同时,单分子实时测序在从头(De Novo)测序、靶向测序和修饰碱基测定方面都有突破性的应用及相关文献发表,尤其在癌基因检测及个性化治疗方面。今年2月,《Cell》杂志发表题为“癌症治疗决策的遗传基础(The Genetic Basis for Cancer Treatment Decisions)”的最新报道。文中,加拿大安大略省癌症研究所通过PacBio RS系统进行临床样本的癌基因及其它癌症治疗敏感/抗性相关的遗传标记的测定,辅助病人的后续治疗方案。该研究所已经通过先期测试积累了大量的经验和数据,正在加快后续大规模临床测试及以此为基础的个性化治疗的进程。
越来越多的研究者认识到,越来越多的研究数据也表明,基于单分子测序获得的长片段和均匀覆盖基因组(无GC偏好性)的测序数据,不仅仅对未知基因组从头(de Novo)组装或宏基因组等群体测序项目优势明显,能够最省时省钱地获得完整基因组,还对靶向测序中突变及SNP的准确鉴定至关重要。
美国Broad(博德)研究院利用PacBio RS系统对千人基因组计划中测得的de novo突变进行鉴定,发现之前基于短片段测序的NGS数据由于错误定位而产生了高数倍的假阳性,短片段测序也无法区分倒位等大段的基因组变异, 从而确认PacBio RS系统是鉴定突变和复制的最佳选择,相关数据即将在《Nature Methods》上发表。
此外,PacBio RS系统在稀有突变测定,修饰碱基测定等等方面也有新的进展。在当今炙手可热的甲基化研究中,PacBio RS也派上了大用场。美国芝加哥大学利用SMRT测序技术和5-hmC的选择性化学标记方法来高通量检测5-hmC。通过聚合酶动力学带来的宝贵信息,研究人员可直接检测DNA甲基化,包括N6-甲基腺嘌呤、5-mC和5-hmC。
第三代测序究竟有多好?PacBio RS系统还有哪些新应用?让我们当面问问专家吧。
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