2011创新产品:微滴式数字PCR系统[新品推荐]

【字体: 时间:2012年03月02日 来源:生物通

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  作为第三代PCR,Bio-Rad公司2011年推出的QX100微滴式数字PCR系统不再依赖Cq值或内参基因,即可确定低至单拷贝的待检靶分子的绝对数目,而微滴技术让数字PCR更低成本,且更实用,克服了之前数字PCR系统的缺陷,如成本高、通量有限且流程复杂,因而摘得“生命科学十大创新产品”大奖。

为了跟上生命科学飞速发展的脚步,2011年末生物通第五次推出“生命科学十大创新产品”评选活动。在这次活动中,我们共收到68个候选产品。经过两个月的读者投票和专家评鉴,2011生命科学十大创新产品终于出炉……

作为第三代PCR,Bio-Rad公司2011年推出的QX100微滴式数字PCR系统不再依赖Cq值或内参基因,即可确定低至单拷贝的待检靶分子的绝对数目,而微滴技术让数字PCR更低成本,且更实用,克服了之前数字PCR系统的缺陷,如成本高、通量有限且流程复杂,因而摘得“生命科学十大创新产品”大奖。

数字PCR(digital PCR,dPCR)是对传统PCR方法的重新定义。两者之间的关键区别在于测定核酸量的方法,而数字PCR的方法更加准确。PCR是对单个样品开展一个反应;而dPCR的样品被分成很多份,每一份都单独开展PCR反应。这样能够更准确更灵敏地测定核酸量。

QX100微滴式数字PCR系统在传统PCR方法基础上采用一种全新的方式进行核酸分子的定量,与传统PCR、定量PCR相比,其结果的精确度、准确性和灵敏度更佳。QX100微滴发生器(droplet generator)将含有核酸分子的反应体系形成成千上万个纳升级的微滴,其中每个微滴或不含待检核酸靶分子,或者含有一个至数个待检核酸靶分子,且每个微滴都作为一个独立的PCR反应器。经PCR扩增后,采用微滴分析仪(droplet reader)逐个对每个微滴进行检测,有荧光信号的微滴判读为1,没有荧光信号的微滴判读为0,最终根据泊松分布原理以及阳性微滴的比例,分析软件可计算给出待检靶分子的浓度或拷贝数。

数字PCR的概念其实早在1999年就由Bert Vogelstein提出,其初衷是为了能够从大量的正常细胞中检测出突变细胞,但由于当时能用于稀释样品的耗材只是384孔板,因此还不能非常好地体现数字PCR的优势。微滴式数字PCR的核心是能够将一份样品分成20,000个纳升级的微滴,因此与其他数字PCR(chamber digital PCR,cdPCR)的技术相比更能体现数字PCR的宗旨与优势——更准确、更灵敏。

由于在扩增前的微滴化处理步骤,使得该技术能够以绝对定量的方式直接“数”出靶分子的个数,因此特别适用于依靠Ct值不能很好达到分辨效果的应用领域:拷贝数变异、突变检测、基因相对表达研究(如等位基因不平衡表达)、二代测序结果验证、miRNA表达分析、单细胞基因表达分析等,当然也包括目前非常热门的无创产前诊断。(生物通 余亮)

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