GWAS研究揭示非阻塞性无精症易感基因

南京医科大Nat Genetics文章

　　

生物通报道：来自南京医科大学，华中科技大学等处的研究人员发表了题为“A genome-wide association study in Chinese men identifies three risk loci for non-obstructive azoospermia”的文章，通过GWAS分析揭示了3种全新的中国人群非阻塞性无精症易感基因位点，相关成果公布在2月Nature Genetics杂志上。

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文章的通讯作者分别是南京医科大学沙家豪教授，王心如教授，以及沈洪兵教授，其中沙家豪教授现任南京医科大学生殖医学国家重点实验室主任，参加国家973项目，国家自然科学基金课题项目等多项重点项目，发表多篇国际杂志、国内核心杂志论文。

据介绍，非阻塞性无精症（Non-obstructive azoospermia，NOA）是最常见的男性不育症类型之一，成年男性发病率约1%，目前已经了解到影响该病的几种的遗传变异形式，但对其病理生理学过程研究的很少。

在这篇文章中，研究人员收集了2927例非阻塞性无精症患者和5734例正常对照。研究人员首先用1000例非阻塞性无精症患者和1703例正常对照的基因组DNA进行Affymetrix SNP6.0芯片检测，并用全基因组关联研究(GWAS)，然后在独立样品中进行了验证，确定1p13.3，1p36.32和12p12.1，3个染色体区域在非阻塞性无精症和正常群体存在显著性变异，这些区域是导致非阻塞性无精症发生的遗传易感因素。

这一发现对于解析非阻塞性无精症的分子机理具有重要意义。研究中采用的Affymetrix SNP6.0芯片服务在博奥生物有限公司完成（详细技术资料免费索取>> >> ）。

同期Nature Genetics杂志还公布了中国科学家的另外一项成果：利用GWAS技术从中国汉族人群中鉴定出了IgA肾病的多个易感位点。

研究人员对5,704名受试者（其中包括1,434名IgA肾病患者，以及4,270名未患该病的对照个体）进行了全基因组关联分析，在随后的研究中进一步对另一组6,167名受试者（其中包括2,703名IgA肾病患者，以及3,464名对照个体）的60个潜在SNPs进行了分析。他们鉴别出了两个易感基因，一个是位于染色体上17p13区域TNFSF13基因，一个位于8p23区域的α-defensin (DEFA)基因。此外，研究人员还发现了与MHC区域以及从前报道的22q12区域的关联性。

研究数据证实MHC区域的rs660895显示了与IgA肾病(P = 0.003)临床分型及蛋白尿和IgA隋品的相关性。这些研究发现对科学家们更深入地了解汉族人群IgA肾病发生的分子机制，探索了IgA肾病风险预测，并为未来IgA肾病的诊断、治疗、新药研发提供了新的靶点。

（生物通：万纹）

原文摘要：

A genome-wide association study in Chinese men identifies three risk loci for non-obstructive azoospermia

Non-obstructive azoospermia (NOA) is one of the most severe forms of male infertility. Its pathophysiology is largely unknown, and few genetic influences have been defined. To identify common variants contributing to NOA in Han Chinese men, we performed a three-stage genome-wide association study of 2,927 individuals with NOA and 5,734 controls. The combined analyses identified significant (P < 5.0 × 10−8) associations between NOA risk and common variants near PRMT6 (rs12097821 at 1p13.3: odds ratio (OR) = 1.25, P = 5.7 × 10−10), PEX10 (rs2477686 at 1p36.32: OR = 1.39, P = 5.7 × 10−12) and SOX5 (rs10842262 at 12p12.1: OR = 1.23, P = 2.3 × 10−9). These findings implicate genetic variants at 1p13.3, 1p36.32 and 12p12.1 in the etiology of NOA in Han Chinese men.

作者简介：

沙家豪
教授，博士生导师

获奖情况
1997年被评为江苏省突出贡献专家；
1998年和2002年入选为江苏省"333工程"第二层次培养对象；
2001年被评为江苏省优秀科技工作者；
2002年获教育部高等学校骨干教师称号；
2003年获江苏省优秀硕士生导师称号；
2004年入选为国家人事部等7部委"新世纪百千万人才工程国家级人选"培养对象；
2004年获全国优秀教育工作者称号。

获奖情况:
1.2004年"人类精子发生相关基因表达谱系的构建及功能研究"初审获江苏省科技进步一等奖；
2.2000年"睾酮生成酶和转换酶的研究"获江苏省科技进步三等奖；
3.1997年"睾丸功能相关基因的研究"国家计生委科技进步三等奖；
4.1995年"精子抗原分子免疫学的研究和应用"卫生部科技进步三等奖；
5.1995年"人精子有效抗原基因表达克隆的研究"江苏省科技进步三等奖；
6.1992年"精子功能的研究"江苏省科技进步三等奖；
7.1986年"棉酚抗生育可逆性研究"国家计生委科技进步二等奖。