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Nature:你的肠道属于哪一类型?
【字体: 大 中 小 】 时间:2011年04月25日 来源:生物通
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若干年后,当你去看医生时,医生也许不仅会问你对什么过敏,还会问你的肠道类型。来自欧洲分子生物学实验室(EMBL)以及国际MetaHIT联合会的科学家发现人类有三种不同的肠道类型。这项研究发表在4月20日的《Nature》在线版上。
若干年后,当你去看医生时,医生也许不仅会问你对什么过敏,还会问你的肠道类型。来自欧洲分子生物学实验室(EMBL)以及国际MetaHIT联合会的科学家发现人类有三种不同的肠道类型。这项研究发表在4月20日的《Nature》在线版上。
我们肠道中有多种细菌,来帮助我们消化食物,分解毒素,产生一些维生素和必需氨基酸,并抵御入侵者。但是,对于微生物群落的组成,个体之间还是存在较大差异。
本项研究的领导者Peer Bork谈到:“我们发现,人体肠道中微生物的组合并不是随机的。我们的肠道菌群可以分成三种不同的类型。”
研究小组利用Sanger测序对欧洲四国(丹麦、法国、意大利和西班牙)的22名个体的粪便DNA样品进行测序。随后他们将这些样品的微生物组与之前的研究结果进行了比较。之前研究人员利用Sanger测序或焦磷酸测序对17名来自美国和日本的个体的肠道微生物组。
随后他们将研究延伸到丹麦的95名个体和美国的154名个体。他们发现,根据肠道中大量出现的细菌种类,所有数据可分成三类,也就是说,每个人都属于这三种肠道类型中的一种。
科学家们尚不清楚为什么不同人会有不同的肠道类型,他们推测,这种差异可能在于人的免疫系统如何区分好细菌和坏细菌,或者与细胞释放废物的不同方式有关。
如同血型一样,这些肠道类型是与年龄、性别、种族和身体质量指数无关的。但是他们也发现,老年人的肠道似乎有着更多分解碳水化合物的微生物基因,这可能是因为,当我们年龄越来越大时,我们处理营养物质可能没那么高效,因此,为了生存,细菌必须承担起这项任务。
Bork还表示,目前存在一些与年龄、体重等性状相关的细菌基因,这也可能成为肥胖或疾病的标志物,这可能对诊断和预后有意义。
如果这是真的,那么在诊断某种疾病或评估某人患上特定疾病的可能性时,医生可能会从细菌上寻找线索。诊断之后,治疗可能也根据病人的肠道类型而定,以确保取得最佳结果。(生物通 薄荷)
原文摘要:
Enterotypes of the human gut microbiome
Nature (2011) doi:10.1038/nature09944
摘要:
Our knowledge of species and functional composition of the human gut microbiome is rapidly increasing, but it is still based on very few cohorts and little is known about variation across the world. By combining 22 newly sequenced faecal metagenomes of individuals from four countries with previously published data sets, here we identify three robust clusters (referred to as enterotypes hereafter) that are not nation or continent specific. We also confirmed the enterotypes in two published, larger cohorts, indicating that intestinal microbiota variation is generally stratified, not continuous. This indicates further the existence of a limited number of well-balanced host–microbial symbiotic states that might respond differently to diet and drug intake. The enterotypes are mostly driven by species composition, but abundant molecular functions are not necessarily provided by abundant species, highlighting the importance of a functional analysis to understand microbial communities. Although individual host properties such as body mass index, age, or gender cannot explain the observed enterotypes, data-driven marker genes or functional modules can be identified for each of these host properties. For example, twelve genes significantly correlate with age and three functional modules with the body mass index, hinting at a diagnostic potential of microbial markers.