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年度创新:植物组织直接PCR
【字体: 大 中 小 】 时间:2011年12月23日 来源:生物通
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参加2011生命科学十大创新产品评选,了解生命科学发展的新动向!植物组织富含多糖、多酚和蛋白等物质,很有可能抑制PCR反应,怎么办?赛默飞世尔派出了Phire热启动 II DNA聚合酶,来对付这些潜在的拖后腿的PCR抑制剂。
DNA提取是许多分子生物学实验的第一步,譬如PCR、克隆和测序。核酸纯化的原始目的是为了去除可能干扰后继反应的杂质,对于PCR技术来说,若是能跳过这一步,直接利用样本进行PCR,那不仅能省钱省力,还能避免交叉污染的风险。由于现在的DNA聚合酶性能已经越来越强大,实验室之间早已流传着各种直接用样品进行PCR的小技巧,不过大多只限于哺乳动物细胞或者细菌类,而甚少涉及植物细胞。
愿望是美好的,现实是残酷的。植物组织富含多糖、多酚和蛋白等物质,很有可能抑制PCR反应,怎么办?赛默飞世尔派出了Phire热启动 II DNA聚合酶,来对付这些潜在的拖后腿的PCR抑制剂。
Phire热启动 II DNA聚合酶是一种特殊的工程酶,融合有DNA 双链结合蛋白,不但聚合能力强,而且对多种植物组织中的PCR 抑制剂表现出超强的抵抗力。有了这员猛将,Phire 植物组织直接PCR试剂盒即可直接从植物样本中扩增DNA,而无需预先进行费时而昂贵的DNA纯化。
此酶是一种特殊的工程酶,融合有DNA 双链结合蛋白,不但聚合能力强,而且对多种植物组织中的PCR 抑制剂表现出超强的抵抗力。有了这员猛将,Phire 植物组织直接PCR试剂盒即可直接从植物样本中扩增DNA,而无需预先进行费时而昂贵的DNA纯化。
无论是新鲜植物还是4ºC贮存或者冻存的植物都可作为模板材料。此外,贮存在诸如Whatman 903® 和FTA® 卡片上的植物材料也可作为模板材料。赛默飞世尔的研究人员还曾用储存于-20ºC 达十年之久的橡树叶片成功进行了直接PCR。
除了DNA聚合酶,Phire植物组织直接PCR试剂盒还包含一整套的优化试剂,制样工具以及对照引物,可以方便地取样和扩增。使用Harris Uni-Core取样器和切片垫取样,可以轻松获得大小均一的样本。取样后,按压活塞将已取到的样本小块直接放入PCR反应液中,开展PCR扩增。
除了直接PCR,试剂盒还提供了另一种稀释方案可供大家灵活选择。试剂盒中的稀释缓冲液可用于PCR 前的样本处理。若样本较大或很困难,如含有较多纤维或者乳胶成分,可以选择先用稀释缓冲液处理。当扩增子 >1kb 时,使用稀释法是一个不错的选择。另外,这个稀释缓冲液也能储存样本,若需要对一个样本进行多次PCR,可先用其稀释。通常情况下,稀释缓冲液中的DNA样品可在-20ºC 储存几个月。不过,据赛默飞世尔的研究人员介绍,用储存了2年之久的DNA样品进行实验,也得到了很好的结果。
目前,赛默飞世尔已经对多种植物样本进行了测试。下表列出了其中一小部分。用此试剂盒测试过的最新植物样本列表详见:www.finnzymes.com/directpcr。
叶片 |
· 拟南芥 · 玉米、水稻、棉花 · 烟草、葡萄藤 |
贮存在滤纸上的样本 |
· 玉米、番茄、豌豆 |
种子 |
· 苹果、胡萝卜、南瓜 |
真菌和藓类 |
· 稻瘟菌 · 菌根(杉木根部多个种类) · 小立碗藓 |