生物芯片 敢问路在何方

　　

生物通报道 近几年，由于新一代测序的出现，以及测序实验的成本飞速下降，大家对生物芯片的应用和关注也在不断下降，甚至有预言认为，芯片技术面临消亡。然而，全球著名投资银行William Blair开展了一项关于生物芯片的调查，结果表明此技术在研究领域仍占有一席之地。

William Blair的分析员Amanda Murphy表示，尽管生物芯片技术目前主要局限于全基因组关联研究（GWAS），但“考虑到这些平台之间的成本差异，我们相信芯片仍将在研究领域占据一席之地”。

她们预计，目前在芯片平台上开展的很多应用最终都将转移至新一代测序平台，然而，新一代测序的成本下降将放缓，因此，从芯片到测序这一转移过程将比投资者们所预测的更加漫长。

William Blair开展了电子邮件调查，收到了84份反馈信息，随后他们与GWAS以及在遗传分析中使用芯片的领军人物进行了对话。这次调查的初衷是评估Illumina的芯片业务，但调查结果也透露了其竞争对手的情况。

尽管Illumina以测序业务闻名，但它最初是以生物芯片起家的，而芯片业务也占了总收入的35%。Murphy提到，GWAS成为Illumina芯片业务的关键推动者，它占了该公司芯片销售额的四到五成。

然而到目前为止，GWAS只提供了疾病遗传的有限信息，特别是对于复杂疾病，关于GWAS的价值，以及这些方法在确定疾病遗传元件上的实用性，目前还存在很大争议。因此，芯片公司开始在芯片上整合一些低频率突变内容，试图克服GWAS的缺陷。

与一年前相比，Illumina第三季度的芯片业务下滑了9%，激发了人们对于芯片业务面临淘汰的担心。出现此问题的不仅仅是Illumina一家。Affymetrix过去一直被认为是基因表达芯片的领头羊，这几年日子也不太好过。

William Blair此次的调查也证实了一些怀疑态度。55%的受访者称，他们不在开展GWAS。而54%的人员表示，他们预计明年的芯片使用将会持平。此外，随着政府的资助缩减，也有人担心芯片研究的资助还可能下降，89%目前使用芯片的受访者称，他们预计2013年的经费将会持平或减少，而70%的人表示，他们实验室暂无计划再买一台芯片仪器。

但是Murphy坚持认为，此技术将会在科研中占据一席之地，并提到一些领军人物对外显子芯片有着特别的兴趣。在10月份召开的美国人类遗传学会年会上，Illumina和Affy都推出了靶定外显子组的芯片。这两家公司认为，这些产品能让研究人员快速经济地验证大量样品中的变异。

Murphy谈到，她预计芯片将会在应用市场继续使用，如诊断和农业基因组学、欧洲群体之外的大规模GWAS研究，以及定向研究，如外显子组芯片。“我们认为今后两年芯片收入都将稳定，而不是买方预测的下降5%。”（生物通 余亮）