华大基因与美国俄勒冈州立大学联手植物疫霉菌基因组研究

　　

2011年11月15日，华大基因和美国俄勒冈州立大学签署合作协议，宣布双方将共同完成9种植物疫霉菌的全基因组测序和转录组分析工作。据悉，此次合作是疫霉菌基因组测序联盟研究项目的一部分，该联盟计划最终完成疫霉菌的150个基因组和300个转录组测序及分析工作。本次合作开启了华大基因和疫霉菌基因组测序联盟合作的新纪元，旨在通过对所有已发现的植物疫霉菌进行全基因组测序和转录组分析，为植物尤其是农作物疫霉菌类植物病原菌防治提供科研基础。疫霉菌基因组测序联盟由即将上任俄勒冈州立大学基因组研究与生物计算中心主任的国际著名植物病理学家Brett Tyler博士发起，并获得了包含全球12位疫霉菌研究专家的顾问委员会的支持。

疫霉菌（Phytophthora）是一群重要的植物病原菌，由其侵染引起的植物病害统称为“疫病”，该类病菌寄主范围广，传播速度快，能侵染各种林木、果树、花卉、农作物等多种植物，引起植物的叶斑、茎溃疡、枝枯、果腐、根腐以及其他营养器官的腐烂，严重时导致整株死亡，每年疫霉菌侵染引起的植物疫病给马铃薯、棉花、辣椒、大豆等农作物的生产带来严重损失，如1840年代造成爱尔兰大饥荒的马铃薯晚疫病和1990年代美国西海岸的栎树猝死病。由于疫霉菌与绝大多数微生物病原体在生物学上关系较远，普通的杀真菌剂等对疫霉菌基本不起作用，因此，培育具备疫霉菌抗体的新品种植物是应对该病的主要策略。

疫霉菌基因组测序联盟成员之一、南京农业大学的王源超教授介绍说：“疫霉菌基因组测序项目是一个广泛的国际合作项目，已经有来自美国、中国、加拿大、荷兰、瑞士、澳大利亚、瑞典等国家的研究人员参与合作。”

加州大学河滨分校的全球疫霉菌库馆长和委员会成员Michael Coffey博士表示：“我非常高兴能够将全球疫霉菌库的资源用于这个令人兴奋的研究项目。全球疫霉菌库拥有所有已知的疫霉菌类型和经过验证的菌株。”

将于今年12月份加入美国俄勒冈州立大学的Brett Tyler博士表示：“我们对于能够携手华大基因共同发起疫霉菌基因组测序联盟感到非常高兴。基于华大基因在基因组测序，转录组研究和生物信息分析方面的专业技能及其在植物基因组研究的丰富经验，我们期望我们的合作能够实现更大的突破，为各种植物尤其是农作物的病虫害防治提供新手段、开辟新途径。”

华大基因主席杨焕明教授说：“我们非常期待能够与美国俄勒冈州立大学及其他加入疫霉菌基因组测序联盟的成员共同合作完成这个非常重要的项目，由华大基因完成的全基因组测序、转录组分析的相关数据和结果将会与疫霉菌基因组测序联盟的成员共享。我们相信通过分工协作，所有的联盟参与者将高效且低成本的获得巨大的收益，并加速植物病原菌的基因组研究进程。”