PCR不再是难题 Phusion实现更高更快更强[新品推荐]

【字体: 时间:2011年02月01日 来源:生物通

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  今年初,赛默飞世尔科技将芬兰Finnzymes公司收归旗下。为啥?看中的就是它丰富的PCR产品线,包括DNA聚合酶、迷你PCR仪、新型PCR管和PCR板等等。也许您还不大了解,那么就让生物通小编来带你看看Finnzymes的明星产品。

今年初,赛默飞世尔科技将芬兰Finnzymes公司收归旗下。为啥?看中的就是它丰富的PCR产品线,包括DNA聚合酶、迷你PCR仪、新型超薄壁PCR管和超薄壁PCR板等等。也许您还不大了解,那么就让生物通小编来带你看看Finnzymes的明星产品。

Phusion® DNA聚合酶是Finnzymes的拳头产品,它所提供的PCR性能是其它DNA聚合酶无法比拟的。它的主要特点可用四个词概括:超保真、超快速、超强劲、超特异。

这些是如何实现的呢?大家都知道,结构决定功能,那我们先来看看它的结构(下图)。双链DNA结合蛋白(紫色)与一种新型的具有校对功能的类热球菌酶(绿色)融合,形成了一种独特的高性能聚合酶——Phusion® DNA聚合酶。

双链DNA结合蛋白的存在提高了聚合酶对双链DNA的亲和力,使得每次酶与双链发生结合反应时都能够掺入更多的核苷酸,并减少了链延伸所需的结合反应次数。Phusion® DNA聚合酶的处理能力大约是Pfu DNA聚合酶的10倍,是Taq DNA聚合酶的2倍。这种强大的处理能力不仅缩短了延伸时间,而且提高了酶的扩增性能,使其能够在更短的时间里扩增更长的模板。另外,与传统的具有校对功能的聚合酶相比,Phusion® DNA聚合酶用量更少,而产量更高。正是这些独特的优点,使Phusion® DNA聚合酶同时适用于常规PCR和要求较高的PCR。

超保真——克隆好帮手

如果你下一步打算克隆,那选Phusion® DNA聚合酶一定没错了。它的错配率极低,是高保真PCR的理想选择。利用改良的lacI方法检测,在HF缓冲液中,该酶的错配率为4x10-7。这个数值比Taq DNA聚合酶大约低50倍,比Pfu DNA聚合酶还要低6倍。需要提醒的是,Phusion® DNA聚合酶产生的是平末端的PCR产物,TA克隆的话可要加A。

超快速——整体循环时间缩短

一般的高保真聚合酶都是慢吞吞的家伙,速度远不及Taq酶,但Phusion® DNA聚合酶却不是这样。它的独特结构决定了每次与DNA结合时都能够掺入更多的核苷酸,延伸速度高达15-30s/kb。其高处理能力大大缩短了延伸步骤的时间,进而缩短了整个反应过程。如果你还想更快,可以选择Phusion® Flash High-Fidelity PCR Master Mix,每kb 碱基的延伸时间仅为15 秒或更少。

由于其结构独特,Phusion® DNA聚合酶的效率也非常高。在任何PCR反应中,该酶的用量显著低于其他常见的聚合酶。Phusion® DNA聚合酶的高速度和高效率使得它能在最短时间内获得高产量。

超强劲——减少反应失败几率

Finnzymes曾做过实验,从Thermus sp.基因组文库中随机挑选16个克隆,并用3种不同的耐热DNA聚合酶进行扩增。结果显示,Phusion® DNA聚合酶具有强劲的性能和速度,它能够成功扩增出随机挑选的16个片段中的15个(94%),并且产量很高。而Pfu DNA聚合酶的成功率仅为56%,Taq DNA聚合酶成功率也才62%,二者的产量明显低于Phusion® DNA聚合酶。而且从图中可以看出,Phusion® DNA聚合酶的延伸时间和酶用量均显著低于Pfu酶,与Taq相当,但产量更高。这些研究结果进一步证实了Phusion® DNA聚合酶的优异性能。

超特异——减少非特异扩增

如果你的模板比较复杂,建议选择Phusion® 热启动II DNA聚合酶。这个第二代的Phusion® 酶在室温时结合了一个Affibody®分子,因此活性被抑制,减少了反应过程中对DNA模板的非特异性扩增和PCR引物的降解。使用Phusion®热启动II DNA聚合酶,反应体系可在室温条件下建立,也适用于高通量的自动化平台。循环开始后,独特的热启动技术让酶瞬时激活,开始扩增。而且Affibody分子对退火温度也没啥严格要求,这样就能使用多种引物,包括那些熔解温度较低的引物。

有了这一手好牌,相信你对PCR应该满怀信心了吧。别急,还有两个好东西要介绍给你。要想实验的进程更快,PCR本身是一方面,上游的样品制备也需要耗费不少时间。核酸抽提,再跑个电泳,半天就过去了。因此,研究人员也在不断开发新的产品,试图跳过样品制备,直接从样品开始PCR。Finnzymes就不久前推出了几个这样的产品。

Phusion® Blood Direct PCR Kit(Phusion® 血液样品直接PCR 试剂盒)就是为全血中DNA的扩增而设计的。它在PCR前无需纯化DNA或进行样品前处理。试剂盒中含有上面提到的Phusion® 热启动高保真DNA聚合酶,适合保真度要求高的实验。此酶掺入率高,聚合能力强,对血液中存在的抑制剂具有极强的耐受能力,甚至当血液浓度高达 40% 时依然保持活性。Phusion® 血液样品直接PCR 试剂盒包含一整套的优化试剂和对照引物,能够对多种血液样品进行分析。

试剂盒中的反应组分均针对血液PCR进行了优化,且与高性能的DNA聚合酶配合使用,能确保多数血液样品都能够得到卓越的PCR结果,这些样品包括:含有肝素、柠檬酸和 EDTA的血液样品、保存于不同类型的滤纸上的血液样品,甚至是经过防腐剂处理的血液样品。此外,试剂盒还可处理来源于不同种属的血液样品。

对于众多的植物学研究人员,同样有一个专为他们开发的试剂盒——Phire® Plant Direct PCR Kit(Phire® 植物样品直接PCR试剂盒)。它能从植物样品中直接扩增DNA,而无需预先抽提。试剂盒采用的是Phire® 热启动II DNA聚合酶,该酶是一种特殊的工程化酶,带有独特的DNA结合域。Phire® DNA聚合酶性能特别强劲,能够耐受植物样品中存在的多种抑制剂。试剂盒包含一整套的优化试剂,制样工具和对照引物,使其成为扩增植物DNA的简单而便捷的选择。当与Piko® 热循环仪和UTW® 管配合使用时,PCR过程在短短30分钟内即可完成。

针对不同目的,有两种实验方案可供选择。在直接PCR方案中,取少量植物样品,直接置入PCR反应混合物,即可进行PCR反应。在稀释方案中,将含有碾碎的植物样品的稀释缓冲液,取少量加入PCR反应混合物中。稀释方案可用于长片段或难扩增的片段,以及从同一样品中扩增多个DNA片段的实验。

目前已对多种植物叶片和种子进行过测试,详见http://www.finnzymes.com/pdf/materials_tested_with_phire_plant_directpcr_kit.pdf

有了Phusion® DNA聚合酶及众多试剂盒的协助,相信PCR不再是难题了吧。Finnzymes还在不断推出更多的直接PCR试剂盒,欲了解最新动态,请关注生物通,或点击索取最新资料。(生物通 余亮)

 

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