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创新参选:染色质免疫沉淀的改进
【字体: 大 中 小 】 时间:2010年09月07日 来源:生物通
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“赛默飞世尔特约之2010实验室创新技术大奖”评选活动开展以来,生物通已经陆陆续续收到不少项目,这些项目中有的能减少实验步骤,有的能降低实验成本,还有一些改进了实验设备,让我们的实验过程更加轻松。活动将于9月8日截止,请有意参赛者抓住最后的机会。
“赛默飞世尔特约之2010实验室创新技术大奖”评选活动开展以来,生物通已经陆陆续续收到不少项目,这些项目中有的能减少实验步骤,有的能降低实验成本,还有一些改进了实验设备,让我们的实验过程更加轻松。
目前生物通已经公布了一些项目,这些项目也倍受读者的关注。为了感谢这些分享实验技巧的参选者,生物通将于2010年9月10日从在此之前投稿的参选者中抽出三名,送出世博会门票一张。
河北医科大学的孙绍光对染色质免疫沉淀(ChIP)进行了一点改进。
背景:经典ChIP技术的主要操作流程包括:(1)甲醛处理使蛋白质与DNA交联;(2)超声波将染色质打断成一定大小;(3)通过抗体沉淀蛋白质-DNA交联复合体;(4)解除交联,用蛋白酶k消化,酚氯仿抽提纯化DNA;(5)PCR检测DNA。但实际操作过程中,经过第(4)步操作,DNA往往会大量丢失,最后造成PCR检测出现误差甚至错误。
方法改进:众所周知,在很多情况下进行PCR检测时,待检样本并不一定要进行核酸纯化,如菌落PCR等。而在进行ChIP时,经过免疫沉淀后,沉下来的是蛋白质和核酸的混合物。常规方法是经过抽提除去蛋白后,再进行PCR检测分析。但是此过程虽然是除去了蛋白,但同时损失了DNA,因此降低了PCR检测灵敏度,见图(上)。我们经过试验证明,在ChIP操作时,将第(4)步中的“用蛋白酶k消化,酚氯仿抽提纯化DNA”省略,直接沉淀加入适量的TE溶解后,进行PCR检测,不但节省试剂和时间,而且实验结果也得到很大改善,见图(下)。
结果: