创新参选:如何提高DNA的酶切质量

【字体: 时间:2010年08月26日 来源:生物通

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  “赛默飞世尔特约之2010实验室创新技术大奖”评选活动开展以来,生物通已经陆陆续续收到不少项目,这些项目中有的能减少实验步骤,有的能降低实验成本,还有一些改进了实验设备,让我们的实验过程更加轻松。为了感谢这些分享实验技巧的参选者,生物通将于2010年9月10日从在此之前投稿的参选者中抽出三名,送出世博会门票一张。

  

“赛默飞世尔特约之2010实验室创新技术大奖”评选活动开展以来,生物通已经陆陆续续收到不少项目,这些项目中有的能减少实验步骤,有的能降低实验成本,还有一些改进了实验设备,让我们的实验过程更加轻松。

目前生物通已经公布了一些项目,这些项目也倍受读者的关注。为了感谢这些分享实验技巧的参选者,生物通将于2010年9月10日从在此之前投稿的参选者中抽出三名,送出世博会门票一张。

中山大学医学院的陈家杰总结了三种方法,能提高DNA的酶切质量。

背景:DNA的酶切主要应用于载体的构建和重组载体的鉴定,还有些线性DNA的制备等。我们时常会碰见因载体的双酶切效率低下而连接失败,还有双酶切切不开重组载体但测序正确影响实验进度,等。DNA的酶切效率的影响因素主要在于质粒载体本身,如市场上大多使用碱裂解法提取质粒DNA,这一方法容易导致质粒DNA上部分酶切位点(Nhe I, Hind III等)容易隐蔽,或者-20度保存质粒DNA容易形成高级结构,质粒DNA在某些宿主(E coli JM109,DH5a等)中部分位点的甲基化等。

方法改进:(1)加热处理,将要进行酶切的质粒DNA直接放于95度水浴10 sec后取出自然放冷,继续进行加样酶切;(2)可采用市场 上胶回收试剂处理质粒DNA(如OMEGA公司的胶回收试剂中Binding Buffer能使质粒的高级结构减少),回收质粒DNA,之后进行酶切;(3)对于一些高GC含量的酶切位如Not I等应当用甲基化缺陷的宿主菌如E coli Top 10等。

结果:提高DNA酶切效率和基因克隆的成功率,节省实验经费。

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