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创新参选:利用Oligo-dT纤维素和Spin Column 柱纯化mRNA
【字体: 大 中 小 】 时间:2010年08月12日 来源:生物通
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“赛默飞世尔特约之2010实验室创新技术大奖”评选活动开展以来,生物通已经陆陆续续收到不少项目,这些项目中有的能减少实验步骤,有的能降低实验成本,还有一些改进了实验设备,让我们的实验过程更加轻松。为了感谢这些分享实验技巧的参选者,生物通将于2010年9月10日从在此之前投稿的参选者中抽出三名,送出世博会门票一张。
“赛默飞世尔特约之2010实验室创新技术大奖”评选活动开展以来,生物通已经陆陆续续收到不少项目,这些项目中有的能减少实验步骤,有的能降低实验成本,还有一些改进了实验设备,让我们的实验过程更加轻松。
目前生物通已经公布了一些项目,这些项目也倍受读者的关注。为了感谢这些分享实验技巧的参选者,生物通已于2010年8月10日进行第二轮抽奖,从在此之前投稿的参选者中抽出三名,送出上海世博会门票一张。
复旦大学的符薇向我们介绍了如何利用Oligo-dT纤维素和Spin Column 柱纯化mRNA。
参选项目:利用Oligo-dT纤维素和Spin Column 柱纯化mRNA
背景:采用Oligotex 试剂盒纯化总RNA中的mRNA,比较昂贵。Oligo-dT亲和层析柱法可用于分离带polyA尾巴的mRNA,但在洗脱上易出问题,严重影响mRNA的得率和质量,有时rRNA很难除干净,影响下一步实验的效果。
方法改进:本方法采用Oligo-dT纤维素分离带polyA尾巴的mRNA,很好的融入了试剂盒的优点,使填充物Oligo-dT纤维素与总RNA直接接触,有利于两者间的结合,提高了mRNA的得率。由于老的Oligo-dT亲和层析柱法按8mg总RNA/1ml床体积填柱,Oligo-dT用量较大,且回收损失大,其他试剂的用量也相应增加,成本消耗大。
本方法采用Spin Column 柱填充,Oligo-dT用量少,且回收损失少,其他试剂的用量也相应减少,使成本降低约50%以上。每克Oligo-dT纤维素一次可纯化10mg的总RNA,且可反复回收利用十次以上,若按每回收一次损失约10%的Oligo-dT纤维素,则每克 Oligo-dT纤维素最终可纯化 55mg总RNA。由于老的Oligo-dT亲和层析柱法填柱不方便,流速难控制,流速过快影响mRNA质量,流速过慢易污染又浪费时间。本方法很好的融入了试剂盒的优点,采用Spin Column 柱,简单易操作,节约时间,且可通过特殊处理反复使用,成本相对较低。
结果:改进后的方法mRNA的得率几乎接近试剂盒的得率,琼脂糖凝胶电泳显示所得的mRNA中rRNA的含量很低或基本除净。
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