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创新参选:升级流式细胞仪数据处理
【字体: 大 中 小 】 时间:2010年06月10日 来源:生物通
编辑推荐:
2010实验室创新技术大奖评选活动开展一个多月以来,生物通已经陆陆续续收到不少项目。不看不知道,原来大家在实验中还有这么多小技巧,小创意。近期开始,生物通将刊登参选项目,与读者分享。如果您的实验也有类似的改进,别犹豫,赶快参选。无论是小改进,还是大创意,我们都欢迎。
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据中山大学的彭博士推荐,在处理流式细胞仪数据分析过程中,可以进行一下改进:
项目:升级流式细胞仪数据处理
背景:流式细胞术(flow cytometery,FCM)是20世纪70年代发展起来的一种可以快速、准确、客观,可同时检测单个微粒(通常是细胞)的多项特性,并加以定量的技术,并且可以对特定群体加以分选。
流式细胞术已经成为了一种广泛使用的技术,用于科研和临床用途,临床上已经成为诊断和追踪疾病一个基础工具,比如HIV感染和肿瘤性疾病。流式细胞仪的数据由大量的可被看成N维空间元素的数据构成。分析这些数据的目的是找出细胞学变化的典型分类群体,作为具有生物学意义的特异性亚群。尽管对流式的数据获取功能有重大的改进,但是数据分析仍然是基于在很久之前确立的二维策略。这还是要依赖于专业操作人员的专业知识,此途径具有主观性,而且具有潜在的导致错误结果的可能。流式数据的自动化分析其本质上是为了改善结果的可重复性。
方法改进:我们中心之前购进了美国BD公司的FACS Calibur流式细胞仪,但是目前这一数据处理系统已不能满足目前的工作需要,因此我们想办法改进。
在升级平台的选择上 在考虑既能支持原功能分析软件又可满足新分析软件运行条件的情况下,选用版本较新,性能稳定的操作系统和较新的硬件系统,保证升级平台有良好的兼容性。
结果:经过技术分析,我们选择的升级平台为PowerPC G4,以及Mac OS9.2.2。PowerPC G4设计已放弃ADB接口,采用了新型的USB串行总线接口,根据相关公司提供的技术资料,需增加ADB-USB适配器来解决硬件加密锁在升级平台上正常工作的问题。
通过软硬件的升级,该数据处理系统整体运行性能得到大幅提升,扩展了流式细胞仪的应用项目,如BD公司新推广的流式微球分析技术也得到临床应用,
经验:随着计算机技术的不断发展及其在医疗设备中广泛应用,许多仪器设备在使用一段时间后,常会面临升级问题,在解决这类问题的实践过程中,应该了解原设备的技术规格和配置清况的前提下,需充分利用现有的技术条件确定升级方案,保证升级平台的兼容性,同时在升级过程中还需注意对原始数据的备份和制定若升级失败后原系统的恢复方案。
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