TaqMan低密度miRNA芯片新升级[新品推荐]

【字体: 时间:2010年03月26日 来源:生物通

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  TaqMan® Array Human MicroRNA Cards的两张卡片套装(卡片A和B)含有特异针对人miRNA的754个独特分析。此外,每张卡片还包含4个对照分析——3个精心挑选的候选内源对照分析和1个阴性对照分析。卡片A更多关注深入鉴定的miRNA,而卡片B则含有多个新发现的miRNA及miR* 序列。

MicroRNA(miRNA)是一类天然存在的非编码RNA,在基因调控中起了关键作用。这些转录本是高度保守的单链RNA(~22个核苷酸),从更长的发夹结构前体转录本中切割而来。MicroRNA通过RNA干扰机制发挥调控作用,它们切割或更常见的是抑制mRNA靶点的翻译,经预测,它们调控了至少三分之一的人类基因。

研究表明,这种新发现的转录后基因调控形式在多个基本细胞进程中扮演了重要角色,包括细胞增殖、分化和死亡。因此,miRNA可能直接参与了人类疾病如癌症的发展,代表了一项有待了解的重要调控机制。

ABI公司的TaqMan分析在研究miRNA时优势多多——高灵敏度、高特异性和宽动态范围,但就是通量低。于是,他们开发出一种低密度芯片TaqMan miRNA Array,在一张微流体卡片上集合了数百个TaqMan miRNA Assay,请看生物通的报道《少量RNA也能进行高通量的miRNA表达图谱分析》。最近,这种芯片经过了升级,覆盖了14.0版的Sanger miRBase数据库。

TaqMan® Array Human MicroRNA Cards的两张卡片套装(卡片A和B)含有特异针对人miRNA的754个独特分析。此外,每张卡片还包含4个对照分析——3个精心挑选的候选内源对照分析和1个阴性对照分析。卡片A更多关注深入鉴定的miRNA,而卡片B则含有多个新发现的miRNA及miR* 序列。为了满足更多重点研究的需求,卡片A和B可单独购买并运行。

为了让流程方便简化,每个TaqMan® Array MicroRNA Cards与Megaplex™ RT Primers(多达381个逆转录引物的预确定库)共同使用。目前有两种Megaplex™ RT Primers(Human Pools A和B),分别与各自卡片上的分析互补。此外,如果样品量有限,或分析灵敏度极为重要时,可加入使用Megaplex™ PreAmp Primers的预扩增步骤。PreAmp Primers显著增加了低表达miRNA的检测能力,仅使用1ng的总RNA,也能产生综合的表达谱。

用Megaplex RT Primers反转录miRNA靶点及用可选的Megaplex PreAmp Primers预扩增之后,TaqMan Universal PCR Master Mix II可与每个反应简单混合,并移至TaqMan Array的八个上样口之一,然后在7900HT定量PCR仪上运行分析。只需5小时,就能运行数百个TaqMan® MicroRNA Assay,是miRNA图谱分析应用的理想方案。点击索取详细资料

另外,ABI近期还推出了TaqMan Pri-miRNA Assays和TaqMan Non-coding RNA Assays,生物通将陆续给大家介绍。(生物通 余亮)

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