《Nature》快评中国大熊猫基因组成果

　　

生物通报道，12月13日，华大基因研究院领衔，中国科学院昆明动物研究所、中科院动物研究所最近在Nature在线版上公布了大熊猫基因组精细图谱研究成果，文章发表后当天Nature头条配发了相关评论文章，15号，又一篇评论文章发表，China celebrates panda genome。

 

该文章称，这是下一代基因组测序计划应用在中国标志性动物身上的成果。

 

据悉，中国大陆目前存活的野生熊猫大约为1600只，为了全方位地了解这种珍稀动物，中国科学家们期望能从基因组序列中获得更多的信息。历时1年多，终于获得这张基因组大小2.4G，重复序列含量36%，基因2万多个的基因组精细图。

 

尽管，大熊猫的基因组测序结果不能发挥保护大熊猫的作用，但至少可以保留这个国宝级动物的遗传信息资料，也许多年后，大熊猫灭绝了，这些资料还有它存在的价值。

 

目前，全球有测序重要珍稀动物的趋势，尤其是哪些地区标志意味深重的标志性动物。比如，澳大利亚就有很多独有的珍稀动物，像袋鼠之类的。

 

早在1992年，澳大利亚国立大学、国立袋鼠基因组研究中心的遗传学家Jenny Graves就曾首次分析珍稀动物的基因序列，当年他曾分析一种南美的有袋鼠类的基因组序列以及鸭嘴兽的基因组序列。

 

有趣的是，当时分析袋鼠基因组序列的时候还顺带发现了一种决定哺乳类动物性别的基因SRY。这类基因在其他哺乳类动物和人类当中都存在，起着决定性别的作用。

（生物通 小茜）

附 获得基因组图谱的珍稀动物种类

Country	Organism	Status
China	Giant panda	Draft assembly in 2009
Australia	Tammar wallaby	Whole-genome map in 2008
United States (Hawaii)	Transgenic papaya	Draft assembly in 2008
France and Italy	Wine grape (Pinot Noir strain)	Draft assembly in 2007
China and United States	Rice	Draft assembly in 2002
Sweden	Norway (European) spruce	Recently announced

 

大熊猫基因组详情

此项目自2008年3月启动，已经完成了大熊猫“晶晶”基因组精细图的测序和组装工作。大熊猫有染色体21对，基因组大小2.4G，重复序列含量36%，基因2万多个。经过二倍体测序，证明大熊猫基因组仍然具备很高的杂合率，从而推断具有较高的遗传多态性，不会濒于灭绝。经过对同源基因的分析发现，大熊猫不喜欢吃肉主要是因为一个基因T1R1失活了，无法感觉到肉的鲜味，但是大熊猫本身没有能够消化竹子纤维的基因，消化竹子纤维则主要靠胃肠道细菌群。在已经进行全基因组测序的物种中，大熊猫基因组与狗的基因组最接近；数据分析结果同时还进一步支持了大多数科学家所持的“大熊猫是熊科的一个亚种”的观点，证明了熊科内部各类群的分类情况。

 

大熊猫基因组精细图这一研究成果，填补了大熊猫基因组及分子生物学研究的空白，将从基因组学的层面上为大熊猫的保护、疾病监控及其人工繁殖提供科学依据。