全面保护组织中的DNA、RNA和蛋白质[新品推荐]

【字体: 时间:2008年11月13日 来源:生物通

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  为了确保在系统生物学中获得具有可比性的结果,在收集组织时组织样品中的DNA、RNA、蛋白应立即稳定。这一点很重要。如果不立即稳定,DNA、RNA和蛋白图谱就会因特异和非特异的降解、诱导和共价修饰而迅速改变。QIAGEN公司的Allprotect Tissue Reagent是第一个无需冰冻就能稳定组织中DNA、RNA和蛋白的解决方案。室温下,新鲜收获的组织浸没在试剂中。试剂会立刻渗透组织,使DNA、RNA和蛋白稳定。

越来越多的学者开始利用系统生物学(systems biology)的方法来研究细胞功能,全面覆盖基因组学、转录组学、蛋白质组学及其他。人和动物的组织正日益成为这项研究中理想的生物样品,因为它们与培养的细胞相比,能更好地代表真实的细胞功能。为了确保在系统生物学中获得具有可比性的结果,在收集组织时组织样品中的DNA、RNA、蛋白应立即稳定。这一点很重要。如果不立即稳定,DNA、RNA和蛋白图谱就会因特异和非特异的降解、诱导和共价修饰而迅速改变。RNA格外敏感,因为RNase无处不在,而样品处理也会导致mRNA转录本的下调。蛋白质也会因蛋白酶的作用而降解,同时基因诱导下新蛋白不断合成。另外,快速、频繁的蛋白修饰也在发生,因为细胞会对样品处理作出应激反应。DNA、RNA和蛋白图谱的变化不仅导致基因组、转录组和蛋白质组的结果不可靠,还会影响数据相关性的研究(例如在mRNA和蛋白水平比较基因表达)。

除了DNA、RNA和蛋白质,我们感兴趣的小分子还包括microRNA、甲基化的基因组DNA和磷酸化蛋白。细胞中这些分子的稳定能确保下游分析取得有意义的结果,并实现不同分析结果的比较(例如microRNA表达与蛋白表达的相关性)。

DNA、RNA和蛋白的同时稳定通常是将组织样品迅速放入液氮中。冰冻的样品随后放在-80°C或用干冰运输,直到开始纯化和分析。然而,液氮和干冰都是危险品,处理多个样品还是不方便。在某些工作环境,液氮缺乏,或不允许使用。这时,我们需要一种室温的稳定方法,来简化收集、稳定、运输和保存组织样品的过程。

QIAGEN公司的Allprotect Tissue Reagent(全面保护组织试剂)是第一个无需冰冻就能稳定组织中DNA、RNA和蛋白的解决方案。室温下,新鲜收获的组织浸没在试剂中。试剂会立刻渗透组织,使DNA、RNA和蛋白稳定。这些分子受到保护,不会被DNase、RNase和蛋白酶降解。另外,还可以避免mRNA转录本和蛋白的上调或下调,蛋白在纯化后还具有酶活性。细胞内的DNA、RNA和蛋白图谱被完整保留,确保下游分析的可靠结果。QIAGEN研发部门还证明Allprotect还能稳定microRNA、甲基化的DNA和磷酸化蛋白。

Allprotect试剂像洗手液一样,是泵装的。只需轻轻一按,试剂就能进入样品管中。Allprotect保护的组织能在室温(15-25°C)保存多达7天,运输时也无需干冰。你也可以将这些组织保存在-80°C。根据QIAGEN研发部门的数据,Allprotect试剂中的组织可以在2-8°C安全保存长达一年。因此,Allprotect提供了冰箱长期保存样品的可能。

Allprotect Tissue Reagent是QIAGEN的生物医学组织管理系统的重要组成部分。该系统整合并标准化了所有样品制备步骤的流程,从样品收集和稳定到样品裂解和DNA、RNA及蛋白的纯化。这个系统包含了一系列AllPrep试剂盒,能同时纯化DNA、RNA和蛋白;DNA和RNA;以及RNA和蛋白。

(生物通 余亮)

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