本期《科学》首先关注文章:杨树基因组草图

【字体: 时间:2006年09月19日 来源:生物通

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  来自美国橡树岭国家实验室(Oak Ridge National Laboratory)环境科学部,生命科学部,以及田纳西州大学植物科学系,西弗吉尼亚大学生物系(West Virginia University)等39处研究机构的研究人员首次获得了一种名为毛果杨Populus trichocarpa(black cottonwood tree,黑三角叶杨)的基因组测序草图,使科学家们能够开始寻找那些遗传密码形成了长活的、木质植物,而不是像拟南芥那样的开花植物。这一引入注目的研究成果公布在本周(9月15日)Science杂志上。

  生物通综合:来自美国橡树岭国家实验室(Oak Ridge National Laboratory)环境科学部,生命科学部,以及田纳西州大学植物科学系,西弗吉尼亚大学生物系(West Virginia University)等39处研究机构的研究人员首次获得了一种名为毛果杨Populus trichocarpa(black cottonwood tree,黑三角叶杨)的基因组测序草图,使科学家们能够开始寻找那些遗传密码形成了长活的、木质植物,而不是像拟南芥那样的开花植物。这一引入注目的研究成果公布在本周(9月15日)Science杂志上。

树木覆盖了地球陆地表面的30%,它们必须制造木制材料,在长距离上协调信号和营养,经历季节变化和其它气候周期而存活。树的基因组将为它们如何完成这些高招提供线索,而且树在一个地点生活几十年甚至上百年,周围的环境不断地变化,它们一定有非凡的生存战略。与拟南芥相比,杨树有抵抗疾病、分生组织(根和幼芽)发育、代谢输运、以及合成植物细胞壁的纤维素和木质素的扩展的基因库,因此遗传有其值得研究的价值所在。

G. A. Tuskan等人利用鸟枪法测序:将基因组分成片段,测序这些片断,然后靠端部序列比较将它们组装起来。通过这个方法与遗传图谱结合起来,研究人员组装出Populus trichocarpa 的基因组草图。并且测序结果表明,该树经历了两个整个基因组复制事件,其中一个发生的时间与拟南芥中发生的同时。除此之外研究人员发现这个杨树的基因组看起来必拟南芥的基因组进化得慢。
(生物通:万纹)

原文:
Science 15 September 2006:
Vol. 313. no. 5793, pp. 1596 - 1604
The Genome of Black Cottonwood, Populus trichocarpa (Torr. & Gray) 
[Abstract]

附:
美国橡树岭国家实验室(Oak Ridge National Laboratory)

美国橡树岭国家实验室(ORNL)聚集了最优秀的实验研究员和理论学者,并为他们提供了最好的分析和计算工具。他们的使命是攻克美国当下面临的最严峻的科学难题,并且开发新技术,为人类创造更加美好的生活,保护人类。 

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