看生物·通天下：基因组测序“大富翁”游戏

　　

生物通报道：基因组测序最近接二连三的引起了大家的关注，见PNAS：更新更快基因组测序方法，其实这一结论早在生物通454测序新方法结合桑格方法完善测序过程 文章中就有阐述，但是当时并没有明确的进行这几种方法组合的比较。

对于PNAS此次的明确的提出要将两个测序方法结合起来，各大媒体分别用不同的分析角度进行了报道，从中可一窥对于测序技术，全球的关注。

其实早在2003年人类基因组测序完成的时候，NIH旗下的国立人类基因组研究院（NHGRI）已经表示将举国进行革命性的DNA测序技术的开发（见下表）。

 

美国的下一代DNA序列技术开放战略
10万美元基因组
概要 作为短期目标，到2008年序列分析成本降低2—3位数，达到大约10万美元	波及效果 为鉴定与一般性疾病相关基因所需的，对数百人到数千人的基因组的DNA序列进行测定成为可能	研究课题的具体例子 大幅提升Sanger法和PCR能力，提高使用毛细管电泳系统的效率方法（美Network Biosystems公司） 珠粒基聚合酶簇（Colony）测序技术（美Agernourt Personal Genomics公司）
1000美元基因组
概要 作为长期目标，到2013年将序列分析成本降低4—5位数，达到1000美元。这一项目不仅仅限于工程技术，还需要研究新的思路	波及效果 能够把对每名患者的基因组DNA测序作为日常诊疗的一部分，个性化医疗	研究课题的具体例子 将在微珠上克隆的DNA放入液滴中，反复进行DNA链伸展和清洗的方法（美Duke大学） 利用“零模式导波管”（ZMW）技术，实时检测聚合酶作用下每个连接到延伸的DNA分子中的核苷酸（美Nanofluidics公司） 作为读取DNA碱基的分子传感器，开放利用聚合酶和核苷酸的系统（美VisiGen Biotechnologies公司）

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（上表引自生物技术世界）

因此围绕着这个主题，不仅NIH等研究单位投入了大量的资金人力，而且由于在未来个性化治疗方面的美好前景，许多生物公司也竞相在这方面花费心血和气力。

以454公司为代表主要是利用纳米技术的高速碱基序列测定技术为目标，结合焦磷酸测序法和光纤制成的皮升（pL，10—12）水平的微反应器装置的两项技术，开发比Sanger技术快100倍的测序仪器，见快速基因组测序时代到来。

之后DOE JGI提出454方法存在一些问题，需要和Sanger方法结合，见454测序新方法结合桑格方法完善测序过程。

紧随其后，今年4月同样是发表在PNAS上的研究报道，美加州大学旧金山分校和伯克利分校的研究人员提出了一项新型技术：100mmDNA测序仪。这个技术在原有Sanger技术的前提下进行了改进，提高了速度，降低了成本，被称为Sanger测序方法的里程碑，见[新技术]Sanger技术的里程碑:100毫米DNA测序仪 。

这一个又一个鲜活的技术成果催动了产业的行动，在去年8月，著名的Agencourt Bisscience公司与哈佛医学院合作在Science杂志上公布了利用普通的荧光显微镜和CCD照相机成本低廉的对基因组测序，这一系统的构建费用是14万美元，每个碱基的测序成本控制在现行成本的1/9作用。

同时为了保有自己在测序行业中的霸主地位，ABI也按捺不住于今年6月以1.2亿美金从贝克曼手中转手收购了Agencourt，估计是希望在未来的测序技术中再领风骚。

除此之外，之上提到改进的Sanger测序方法也是由Microchip Biotechnology（MBI）这家美国加州生物公司持有，还有Li-Cor Biosciences同时也在研发一项检测核苷酸插入到单链DNA样品中的技术等等。

当然还有提到的是一直在测序领域赫赫有名的Solexa公司，在今年3月其公司总裁就提出了基因组重新回温的说法（见Solexa水涨船高 454十分忐忑不安），目前看来确实颇有预见性。但是在未来的测序技术风起云涌的氛围下，国内的测序行业是否依然被远远的甩在后面呢？
（生物通：张迪）