PNAS：更新更快基因组测序方法

　　

生物通报道:美国和澳大利亚科学家们倡导了一种混合方法（hybrid method）进行基因组测序，这种方法比当前技术水平的方法更快速和廉价。

这项突破备受存在着日益增长的基因组测序要求的医学和生物技术领域欢迎。该新混合方法联合了新旧指纹识别生命遗传基础的破解方法的优点。

来自Craig Venter研究所和悉尼新南威尔斯大学（University of New South Wales） 科学家们在《Proceedings of the National Academy》上发表了该研究成果。

“破解一种生物的整个遗传密码耗费昂贵，并且直到现在，还是依赖于具有30年历史的物理分离基因片段的旧技术的基本原理。” 来自新南威尔斯大学，该文章的合作作者Torsten Thomas博士说。

“过去几年里利用real-time和 light-based进行观察基因的合成从而揭示基因组信息的新方法出现了。它产生基因组信息的速度比旧方法快100倍。”

利用六种海洋细菌的基因组，科学家们评估了新旧方法的效用和性价比，来证明利用混合方法要比单独利用一种方法要好得多。他们发现结合两种测序方法优点的混合方法能产生更好质量的基因组信息。

该研究小组发现传统的Sanger测序方法在测序大的基因组片断时表现得最好，而新方法——pyrosequencing则更适应于测序更小，更困难的片断，例如由二级结构导致的无法克隆的区域和空隙。与以前的技术相比，混合测序方法使得科学家能够更容易的关闭基因组片断的测序空隙。

研究者们表示这种混合测序技术将会成为一种测序小型微生物基因组的首选方法，而Sanger测序法在测序大片段DNA显得更游刃有余。“该新混合方法已经对几种海洋微生物进行测序，我们希望这些我们的这些成果能起动之前出于经济考虑受阻的其他的基因组计划。” Thomas博士说。
(生物通:亚历)