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重要研究进展:确定miRNA细胞特异信号
【字体: 大 中 小 】 时间:2006年02月23日 来源:生物通
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生物通报道:虽然目前科学家们已经知道人类基因组中包含着成千上万的microRNA(miRNA),而且这些miRNAs可以调节许多mRNA的翻译,但是这些miRNAs对组织特异mRNA的整体作用还未得到系统的阐述。近期来自纽约大学比较功能基因组学中心的研究人员分析发现由几个高组织特异性miRNAs靶定的mRNA会根据miRNAs存在与否改变其表达水平,这证明了miRNA对组织特异性mRNA的影响,也提供了一种新的分析miRNA3’UTR的工具。这一研究成果公布在2月21日的PNAS杂志上。
miRNAs是一种21-25nt长的单链小分子RNA,参与了生命过程中一系列的重要进程,包括发育进程,造血过程,器官形成,凋亡,细胞增殖,甚至是肿瘤发生。这一小RNA的一个重要特点是细胞特异性或组织特异性,比如说拟南芥中的miR-171仅在其花序中高水平表达,在某些组织低水平表达,在茎、叶等组织中却无任何表达的迹象;20-24h的果蝇胚胎提取物中可发现miR-12,却找不到miR3-miR6,在成年果蝇中表达的miR-1和let-7也无法在果蝇胚胎中表达。但是这一特异性至今为止并未得到完整阐述。
纽约大学Pranidhi Sood等人通过一种计算机分析工具将当miRNA过量表达或者敲除的时候,mRNA水平多少的变化与3’UTR联系在一起,发现在相同组织中,高组织特异的miRNAs的作用靶目标——mRNA表达水平会比组织中没有这种miRNA的时候低。相反,高表达基因转录出很多mRNAs,但这些mRNA并没有在同样组织中的miRNAs识别位点。
(生物通记者:张迪)
原文:
PNAS | February 21, 2006 | vol. 103 | no. 8 | 2746-2751
Cell-type-specific signatures of microRNAs on target mRNA expression
Pranidhi Sood, Azra Krek,, Mihaela Zavolan, Giuseppe Macino, and Nikolaus Rajewsky