Bio-Rad推出siRNA合成新方法

来自Bio-Rad公司的消息，Bio-Rad与集成DNA技术公司（Integrated DNA Technologies，IDT)联手发展一种获得有效的27mer Dicer酶作用（Dicer-substrate）siRNA双链的方法。通过这种方法，可以获得有效预设的siLentMer siRNA双链。

　　

生物通报道：来自Bio-Rad公司的消息，Bio-Rad与集成DNA技术公司（Integrated DNA Technologies，IDT)联手发展一种可以获得有效的27-mer Dicer酶作用（Dicer-substrate）siRNA双链的方法。通过这种方法可以获得有效预设的siLentMer siRNA双链。

之前的研究认为在没有引起干扰素应答（interferon response）的条件下，只有21-23nt双链siRNA才能激活RNAi途径（Elbashir et al. 2001)，但是来自美国希望之城国家医学中心（the City of Hope）和IDT的研究人员证明无干扰素应答激活的前提下，27-nt的siRNA双链实际上能有效的激活RNAi途径，并且比经典的21-mers siRNA更早激活这一途径（Kim et al. 2005)。这些研究数据表明27-nt双链是由RNaseIII家族成员：Dcicer酶加工获得的，而且27-mer siRNAs常常表现出比21-mer siRNA能更有效的RNA干扰效果。

因此在这一理论基础上，IDT建立了27-mer设计运算法则（algorithm），相关生物信息学和高质量合成方法，并推出了siLentMer Dicer-substrate siRNA双链合成。这些双链已由Bio-Rad研发部专家经过了性能验证和有效性验证，可以减少至少85%的mRNA表达。除此之外，这种siRNA对于建立有效siRNA库也很合适，多种靶标的多siRNA双链合成可以产生复合生物学效应，有利于特异兴趣基因的确定敲除。

当siRNA序列与兴趣基因非特异性序列mRNA转录本相似的时候就会产生脱靶效应（off-target effects）（Jackson et al. 2003），这会引起基因表达谱的错误识别，从而导致与目标基因无关的转录本沉默。

为了避免这种情况出现，siLentMer siRNA双链：

• 利用先进的生物信息学对敲除特异性同源序列进行分析，确保特异靶标。
• 低浓度（(≥5 nM）有效性：在siRNA高浓度的时候才会发生脱靶效应，为了减少这一效应，siLentMer siRNA在低浓度时提高了有效性
• HPLC级纯化siRNA保证了一致和可靠的结果。

除此之外，序列有效性(Anon. 2003)和足够的实验对照也能减少脱靶效应的产生，siLentMer siRNA包含了阳性和阴性对仗，能确保沉默和简便结果分析。（生物通：张迪）　

附：
美国IDT公司简介


美国IDT公司是北美也是世界上最大的专业合成DNA、RNA公司，产品主要应用于研发和医疗诊断， 客户超过75,000名。公司建立于1987年，二十年来每年以50%的增长发展，北美市场占有率接近40%，而剩余60%的市场由其他上百家大大小小的合成公司分享。 IDT每天可以合成25,000条引物, 拥有400名专业科技人员，能满足各个领域的广大客户的需求。 

特色： 

世界上最优质的质量- 严格的质量控制， 对每一条引物都进行质谱分析，从而对引物的缺失和突变进行了更加严格有效的把关。 
品种齐全 ，提供全面的各类修饰和常规引物，满足各方面的需求。 
提供96/384板引物，为基因芯片和诊断试剂盒生产厂家提供最高质量的引物。