Science：最小的基因组

　　

生物通报道：俄勒冈州立大学（Oregon State University）的研究者们8月18日在Science上公布目前所知的最小基因组——细菌Pelagibacter ubique（简称P. ubique）的基因组测序完成。这一基因组虽然只有很少数目的已知“垃圾”DNA，但也包含了生物合成所需的20种氨基酸。

P. ubique是一种生活在海洋中的异样细菌，浮游在海面上通过光合作用或者呼吸作用将获得的有机复合物转变成自己的能量。这种细菌由于其特殊的进化地位与基因结构受到科学家的关注。

俄勒冈州立大学研究者获得的数据表明，这种细菌只有1,308,759个碱基，缺少假基因、内含子、转座子、染色体外遗传因子（extrachromosomal elements）、内含肽（intiens，指近年发现的一种新的翻译后加工的产物，是一个蛋白质剪接元件，类似于基因组中的内含子intron在RNA的剪接中所起的重要作用，生物通注）等结构，而且它的旁生性同源基因（paralogs，指序列是同源而不是明显的正源关系的基因，生物通注）和在任何细胞可见的“最短基因间隔区”（intergenic spacers）都很少。基本上这种细菌基因组只包含典型细菌细胞基因的30%左右的基因。研究人员还认为，这种P. ubique的基因除了可以提供合成20 种氨基酸的完全生物合成途径，也能合成一些“all but a few cofactors”。（生物通记者：张迪）