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跳动的脉搏
快速基因组测序时代到来
【字体: 大 中 小 】 时间:2005年08月02日 来源:生物通
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生物通报道:当Jonathan Rothberg的小儿子出生六个月以后,Rothberg就把他送到婴儿加护病房去了,因为Rothberg担心小BB有些问题,所以他希望能获得BB基因组的相关信息。但是这在以前简直是妄想:每个测序反应需要上百万甚至上千万美元,而且还花去十年的时间——2001年Nature刊登的文章指出。然而Rothberg并不死心,因此他尝试发明一种快速便宜的测序技术。现在他终于能实现这一梦想了,根据在他自己创建的454生命科学公司(454 Life Sciences Corporation)里完成的研究,他与他的同事在Nature上发表了这一结果。
在文中,主要研究者Marcel Margulies、Michael Egholm以及其它同事详细描述了他们这种比目前的Sanger测序方法要快100倍的技术。目前基于Sanger测序方法的机器一般每个小时可以读取67,000个DAN密码子碱基字母,而Rothberg称他的方法在1小时内可以破译6,000,000个碱基。“我们要比Sanger方法快100倍,而且我们还只是刚刚开始。”Rothberg说。
这种方法如此之快,主要是由于其自动化的原因。整个过程,从最初的DNA片段复制到测序,全部都是采用微流技术(micorfluidic technologies),而且可以同时分析数以千计的DNA分子。相比而言,Sanger测序则要在每个步骤上花费许多时间和不同的技术。Rothberg说,利用454技术,在100天内即可测完人类30亿的的碱基。并且随着这一过程越来越快,基因组测序也会越来越便宜,在几年之后,也许只需要$10,000了(生物通记者:张迪)。