工具革命：基因组序列处理只需数分钟

　　

生物通报道：最近，美国能源部太平洋西北国家实验室的一个新的计算机工具将加速人们了解生命机器的速度，并使我们向着治愈疾病、找到更安全的清洁环境和保卫国家不受生物恐怖威胁的方法又前进了一步。这种叫做ScalaBaLAST的系统是一种复杂的“序列联盟工具”（sequence alignment tool），它能将分析生物资料的工作划分成容易处理的片段，因此能够同时处理大量的信息。这种技术意味着大规模的问题如生物的分析能够在数分钟内解决而非数周。

PNNL的研究人员表示ScalaBLAST能用于处理复杂的基因组测序。利用ScalaBLAST，研究人员能处理大量在人类基因组研究中产生的新问题。在没有这个工具前，研究人员需花费10天的时间来分析一个生物，但现在能在9个小时中分析13个有机体。

拥有了利用这种计算机工具处理大量信息的能力还能够使人们对微生物通过生物补救过程处理有毒污染物的机制有新的了解。它还会有助于了解微生物细胞的成分，并促使开发出更好的用于国防安全的检测方法以使我们能够更快确定并对威胁作出反应。

ScalaBLAST是PNNL的高级计算技术实验室（Advanced Computing Technology Laboratory）的一个产品，研究主要由美国能源部高级科学计算研究办公室资助（记者杨淑娟）。