线虫基因组中丢失的基因被发现

【字体: 时间:2005年05月13日 来源:生物通

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生物通报道:华盛顿大学的计算机研究人员已经开始应用他们开发出的一种专门研究线虫基因组的新软件,并且已经发现了先前用其他基因组分析方法漏掉的150个基因。而且,利用这种软件,研究人员预测还有存在多达1119个基因。Brent和同事将他们的发现公布在20054月的Genome Research上。

Michael Brent博士用在秀丽隐杆线虫基因组上的分析软件叫做TWINSCAN。另外一种线虫C. briggsea的基因组还被用于确定两个种的最近的共同祖先发生变化的序列部分。首先,他发现TWINSCAN能够精确预知60%的线虫基因组中的基因。

线虫是动物发育和遗传学研究的生物学模型,并且是第一个完成测序的动物基因组。线虫研究人员依靠的是一个叫做WormBase的基因组数据库。除了确定的基因外,WorBase还包括成千上万个预测到但没有来自cDNA或表达序列标签(EST)的确切证据的基因。Brent和同事认为WormBase的精确性可以通过使用TWINSCAN预测加以改善,而且他们还预言人类基因组预测者的年代正在过去,未来属于计算机破译的年代。

由于计算机速度的不断提高,线虫TWINSCAN分析能够用于比先前分析方法更精确的内含子长度模型(记者杨淑娟)。
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