Nature:蛋白酶动力学结构新解

【字体: 时间:2005年11月07日 来源:生物通

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  生物通报道:Brandeis大学发表在本周《Nature》上的一项研究加深了人们对蛋白的动力学特性的一些基本认识,并且认为这些酶比以前想象的更具有可变性,即更具有可塑性。这项基于核磁共振(NMR)的实验可能启发人们更加关注于如何通过将酶和动力学靶标结合来改善理性药物设计。
Brandeis大学生物物理学家Dorothee Kern,其也是哈佛霍金斯医学研究所的研究员,说到目前为止,这项研究第一次将酶的低能量状态和较少出现的高能量状态与其功能相联系。
这很重要,因为药物会找寻稀有的较少出现的靶酶来结合,停靠。Kern相信这项研究将使致力于阐明最终用于理性药物设计的高能态酶的结构研究新领域的科学家朝该领域前进一步。
Kern解析道,这项研究改变了我们对蛋白如何发挥作用的认识范例。传统观点认为酶不行使功能时,其动力学变化不大,只有在其活性状态时,也就是催化时,动力学特性才有大的改变。我们现在所知道的是没有静息态,即使缺少底物,在催化前,许多原子也固定地运动,这也是这些酶的本质特性。
Kern――在1989年柏林墙倒掉之前是东德国家队的篮球运动员,后来是联邦德国的职业球员,解析说,这很像篮球比赛,选手们一直有策略地带球或者不带球运动。自然界已经使这些生物分子进化以至于它们能持续地在固定方向运动,有助于它们在有底物和没有底物时起作用。
这项研究包括用NMR技术研究亲环蛋白A酶――从酵母到人体中都发现其存在的高保守的蛋白,在人类HIV的复制中也起作用。阐明亲环蛋白A在人体中的作用将是开发阻断其毒力,而且不用干扰正常细胞功能的药物的一个重要一步。
Kern总结道,生命的基本原理就是分子随时间持续改变,意即动力学的含义(生物通记者 朱方雨)。
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