[候选优秀论文]研究基因调控的新技术

　　

【编者按】：为了鼓励更多的优秀论文在国内的核心刊物发表以及鼓励和发掘极具潜力的青年科学家，表彰优秀的实验成果，国内的一些核心期刊、生物产品厂家与生物通联合举办了这次中国05-06生命科技年度优秀论文评选活动。为了让广大读者能够从这次活动中了解更多的国内科研进展，同时了解更多的科研技术，生物通将对获得投票数较多的文章进行介绍。这次介绍的是目前暂时投票数领先的文章。

候选优秀论文：王春雨，石建党，朱彦，张琚.染色质免疫沉淀技术在研究DNA与蛋白质互相作用中的应用，遗传.27（5）：801～807.

 文章介绍

    在后基因组时代，DNA-蛋白质的相互作用是研究基因表达调控的一个重要领域。与其他方法相比，染色质免疫沉淀技术（chromatin immunoprecipitation assay, ChIP）是一种在体内研究DNA-蛋白质相互作用的理想的方法。近年来这种方法与DNA芯片和分子克隆技术相结合，可用于高通量的筛选已知蛋白因子的未知DNA靶点和研究反式作用因子在整个基因组上的分布情况，这将有助于深入理解DNA-蛋白质相互作用的调控网络。论文总结了染色质免疫沉淀技术的方法，特别介绍了使用这些方法取得的最新进展。

 技术介绍

    我们知道可以利用Sourthern Blot研究DNA与DNA之间的作用，利用Western Blot研究蛋白之间的作用，利用Northern Blot研究RNA与DNA间的作用。那么DNA与蛋白的结合也是相当稳定，研究这两者间相互作用的实验技术称之为什么呢？首先，要声名一下反正不是叫Eastern Blot。

    研究DNA与蛋白质相互作用的常见的方法主要有电泳迁移率变动分析（Electrophoretic Mobility Shift Assay, EMSA）,DNaseⅠ足纹法（DNaseⅠfootprinting），酵母单杂交系统（Yeast One-Hybrid System）等；另外，生物信息学的方法也可以预测DNA上的转录因子结合位点的保守（consensus）序列。这些方法的应用大大促进了该领域的研究，但它们都有一定的局限性，不足以充分反映生理条件下DNA与蛋白质相互作用的真实情况。

    染色质免疫沉淀技术是一种在体内研究DNA和蛋白质相互作用的方法。它的发明最早可以追溯到20世纪60年代，早期曾多用于研究核小体上的DNA和组蛋白的相互作用以及组蛋白的修饰。近年来，此技术经过不断的发展和完善，特别是与DNA芯片和分子克隆技术相结合，可用于高通量的筛选已知蛋白因子的未知DNA靶点和研究反式作用因子在整个基因组上的分布情况。该技术在国外已经得到了广泛的应用，安捷伦公司推出有ChIP-on-chip平台，Active Motif公司最近也推出相关试剂盒。也有一些科学家已经利用此技术做出不错的科研成果，比如在之前生物通报道的来自美国犹他州大学的华人科学家张海英研究酵母中一种出现频率较少的组蛋白Htz1时，就使用此技术研究Htz1与酵母基因组中启动子结合的偏好性，文章发表在Cell上。但是，这种技术在国内还鲜有报道。

    这项技术流程示意图如下：

更详细的内容可以从原文中获得：染色质免疫沉淀技术在研究DNA与蛋白质相互作用中的应用，如果有收获，一定记得要花上一分钟投票哦！

 作者介绍

第一作者：王春雨（1979-），男，天津市人，博士研究生，专业方向：医学分子生物学

通讯作者：张琚（1956-），女，天津市人，博士，教授，研究方向：医学分子生物学

张琚，天津市人。南开大学生物化学专业本科及硕士研究生毕业。1989.5-1994.l在奥地利因斯布鲁克大学生物化学所读博士学位，从牛肝线粒体膜上分离纯化了一种NAD+糖水解酶，氨基酸序列分析证明其是一未知蛋白。此研究成果分别在《FEBS LETTER》和《Biochemistry》上发表。1994.1获奥地利理学博士学位。1994.1-1996.1在奥地利因斯布鲁克大学泌尿医院前列腺研究中心作博士后，在体外成功地培养了前列腺的平滑肌细胞，为前列腺基质增生病因及治疗药物的研究奠定了基础。1996年在南开大学分子生物学研究所任研究员。1998.9-1998.12再次赴德国柏林泌尿医院进修。从事金属蛋白酶及其抑制剂在前列腺基质细胞中的表达及调节的研究。1999年初被评为南开大学生命科学院博士生导师。现专职从事科研工作。研究方向为：“前列腺增生基质病变的分子机制”“前列腺癌微小转移的分子生物学指标”“金属蛋白酶在前列腺癌转移中的作用”。自95年至今在前列腺研究方向在国际国内杂志上发表了20余篇学术论文。

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记者 谢菲

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