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如何选择下一个测序的生物?
【字体: 大 中 小 】 时间:2005年11月29日 来源:生物通
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生物通报道:人类基因组测序基本完成、猪基因组测序完成、流感基因组测序完成,今年一个又一个的生物有机体测序完成,说明目前测序手段基本完善,而我们下一个要选择谁作为研究测序的对象呢?来自世界三大生物信息学数据库之一——EMBL-EBI(European Molecular Biology Laboratory-European Bioinformatics Institute,欧洲分子生物学实验室暨欧洲生物信息学中心)的科学家们指出选择一个重点的“候选者”和提早选择几种生物都是同样重要的,他们将这一结论发表在了11月25日的PloS Genetics杂志上。
文章作者,即EMBL-EBI研究人员Fabio Pardi表示,“假如这一研究机构与外界沟通良好的话,那么两家不同的测序机构就不会选择同一个生物来研究,选择下一个更有吸引力的生物体来测序是有效的策略。我们假设一下,如果能获得最多信息的生物体是在进化地位上分支最大的生物,那么要选择哪一个物种来测序的问题就可以通过比较未测序的物种与已经获得其基因组的物种之间的分支长度,以及不去选择已经得到测序最长的分支的生物体来得以解决。”但是Pardi也在文中提到,除了进化分支以外,也要考虑像这一生物体的经济重要性等问题。(生物通记者:张迪)