siRNA检测芯片:RNAi基因沉默新技术

　　

生物通报道：Genetix公司能够提供一系列适合检测RNA干扰研究中siRNA分子干扰效果的基因芯片产品。在即将来临的RNAi欧洲会议（2004年10月18到19日，伦敦）上，Genetix将会介绍他们的QArrayMini生物芯片和可选择蓝色激光的aQuire基因芯片扫描仪，这一组合是进行RNAi优化实验的完美配套产品。

RNAi已经发展成一种强大的分子生物学研究工具，用于沉默细胞中的目标基因。研究人员能够使用各种不同的技术将双链siRNA分子（一般长度为20－25个核苷酸）引入到哺乳动物细胞中。一旦进入细胞，这些分子就会与互补的目标mRNA和特定的蛋白相互作用并形成一个RNA诱导沉默复合物（RNA-induced silencing complex，RISC），这种复合物降低甚至彻底关闭目标基因的表达水平。

通常针对特定某个基因的RNAi研究中，都需要检测和优化一系列寡核苷酸序列的“沉默”效率，现在这个任务能够利用基因芯片以平行和高通量的方式完成。利用QarrayMini或Qarray2能够将合成的siRNA双链或siRNA表达质粒（在细胞中质粒的转录产物会被加工成siRNA分子）与脂质体转染试剂按照矩阵排列在基因芯片上。然后在芯片上覆盖单层的贴壁细胞，随后接触到样品点阵细胞会被转染。当细胞株中的目标蛋白与GFP融合表达时，由于说在玻片上覆盖的单层细胞均可表达带有绿色荧光蛋白的目标基因，玻片在检测时呈现绿色荧光，当点阵上的siRNA/质粒经转染试剂转染后，转染细胞中目标基因表达被沉默而出现荧光亮度降低或者没有荧光的暗区，根据在一片绿色荧光中检测每个点的荧光减弱的程度就可以检测每种siRNA分子的沉默效率。使用带有蓝色激光的Genetix aQuire扫描仪还能够获得GFP融合蛋白表达细胞的影像。（Yang Shujuan）