两种植物病原菌基因组测序完成

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生物通快讯：大豆疫霉菌（Phytophthora sojae）是分布广泛、危害极其严重的土传性病害，可导致大豆根腐病，感病品种几乎绝产的毁灭性病害。Phytophthora ramorum则在美国加州造成橡树猝死灾害的类似真菌的病原菌。6月10日，测序人员公布了Phytophthora ramorum和大豆疫霉菌的基因组全序列。植物病理专家第一次可以全面了解这两种类似真菌、可危害多种植物的病原菌——疫霉菌（Phytophthora）的完整基因组。最新公布的测序结果将有助于了解病原菌侵害植物的的基本机制并为战胜这种已经在美国传播开来的橡树猝死病提供新的工具（Science, 3月26日）。

从2002年开始，美国能源部、农业部和美国国家科学基金提供了大约400万美元的经费用于此项研究。这项研究由位于加州Walnut Creek的美国能源部（DOE）联合基因组研究所（Joint Genome Institute）和维吉尼亚生物信息学研究所（VBI）负责进行。之所以选择大豆疫霉菌（P. sojae）是因为对它已经有过较多的研究并且它的基因组相对比较简单。它的长度为95Mb，而2000年发现的p. ramorum的长度更小为65Mb。

VBI的Brett Tyler说两个种的类似之处是往往会在含有某些寄主特异性基因的区域入侵，这说明具有特异性。另外一个首次发现是攻击植物防御系统的蛋白对应的基因尤其丰富。“它们似乎在迅速的进化”，Tyler说。

维吉尼亚技术中心农业研究和拓展中心（Virginia Tech’s Agricultural Research and Extension Center）的Chuanxue Hong说这个测序结果将有助于研究人员找到更多关于这种病原体和它的寄主间如何相互作用的信息，并且将可能导致疾病抗性植物的产生。“从长远的观点来看，这些基因组意义重大”，Hong说。

Tyler预言，这个基因组的最直接的回报是将会成为确定和追踪P. ramorum的最好的方法并且在一年内将会有新的测试。加州大学的Matteo Garbelotto这个基因组还有助于确定两种P. rmorum杂交类型在北美洲是否活跃，人们担心这种杂交将产生更强的毒害性和影响更广泛的宿主。他的实验室提供了测序所需的病原体。“我们将真正能够确定这种有机体的生物学特征。”他还说一些基于植物对Phytophthora攻击蛋白的反应的新检测方法也将极大地简化检测过程。