科学家开发出更快的测序技术

【字体: 时间:2003年11月24日 来源:

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[生物通讯]迄今已有约150个不同的基因组被测序完毕,包括人类基因组。但现在测序的需求前所未有的迫切:2003年3月,布什政府宣布在未来5年内将投入10亿美元来开发DNA法医分析,数量多达300,000个样本。基因组医学领域有望提供更佳的疗法和诊断方法,而其发展和成功依赖于更快的测序技术。

今年秋天,Whitehead研究所的研究人员将检测一种能加速基因组医学领域研究的新技术。BioMEMS 768测序仪能在一年内测序人类整个基因组,每天处理多达7百万个碱基对,这个速度比第二快的测序仪还要快7倍。科学家是在1999年开始实施这个计划的,从美国国家人类基因组研究院获得了7百万美元的资助。这一技术最终将有助于科学家快速准确地确定多种不同生物的遗传序列,使研究人员可以更快地对犯罪案件中的DNA样本进行法医分析。

这种新BioMEMs测序仪的核心部分是一个大玻璃芯片,,上面分布着一个个狭小的微通道。该测序仪一次可以检测384道DNA,是现有毛细管测序仪的5倍。每个微通道都能容纳更长片段的DNA:誉为850个碱基,而当前的测序仪每道最多只能容大55个碱基。

BioMEMS768个通道中,每个通道DNA的读取需要45分钟。这个仪器实际上含有两个芯片,当一个测序时另一个也准备好随时接受任务,因此BioMEMS可以全时测序。这个新测序仪节省的不仅是资本成本,还有每天的日常费用。

“节省的这不仅是这台仪器的成本,还有所需研究材料的节省。”Whitehead研究所的高级软件工程师Brian McKenna说。他们的目标是用与现有测序仪同样的消耗--溶液、化学物质以及其它制备DNA所需的材料,测序出更多的DNA。BioMEMS 还运用了一个新的DNA加载过程,这个过程使测序只需通常DNA测序样本的1%。

虽然这个测序仪由Whitehead研究所发明,但已转让给了麻省的一家生物公司,该公司由Whitehead成员Paul Matsudaira、BioMEMS实验室主任Dan Ehrlich和研究科学家Lance Koutny创立。日本的Shimadzu Biotech公司将生产BioMEMS测序仪。(生物通编译)

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