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RNAlater:彻底告别RNA降解的烦恼
【字体: 大 中 小 】 时间:2001年04月24日 来源:生物通原创
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一旦生物样品被收集采摘,离体组织的RNA会立刻变得非常不稳定,极易被降解。由于特异及非特异的RNA降解,或者由于样品采集过程中的应激反应产生新的RNA都会引起RNA状态的改变。对于生物芯片、基因表达矩阵分析(Array Analysis)、定量RT-PCR等实验来说,采样后立即稳定样品里的RNA以保存当时RNA的表达状态,是精确/定量研究基因表达分析的重要前提。记得以前学植物遗传的同学常常要带着液氮罐,骑着单车到田里采样——那个液氮罐的盖子有点问题,一颠就冒白烟,吓得一路上行人、车辆纷纷躲避,很是招摇,据说有一次觉得液氮不够了,赶着坐出租回来,那可是连哄带骗才上了的士,到学校时司机已经紧张得面无人色了——这真令贪玩的我们非常羡慕,只恨这等趣事怎么就落不到我们头上。对当事人来说,每周一次带着液氮罐到处跑实在不算一种有趣的经历。没有办法,为了保持样品的RNA完整真实,要么当场提RNA,要么液氮保存,一直如此。不过自从有了RNAlater,这种有趣的场面就会越来越少了。
RNAlater是特殊的样品储存液,只要在采样后立即将新鲜样品浸入这种液体试剂,RNlater可以迅速渗透到组织或其他生物样本中,稳定并保护RNA完整而不被降解,确保下游分析得到的数据真实反应样品的表达信息。样品储存液中保存的新鲜样品可以在不超过37度的高温天气下保存一天,或者在25度室温下保存一周;或者4度冰箱存放一个月;或者负20度长期保存而使RNA保持完整免受降解。这种技术为在不同温度和不同地点下的采样、运输和保存样品提供了极大的方便,同样适合手术/解剖过程中部分样品的保存。
RNAlater的用法非常简单,只要在采样后立即将样品完全浸入适量(10ul/1mg组织或者5倍体积)的RNAlater中即可。取样的动作要尽量快速利索,组织样品的大小以厚度不超过0.5公分为宜。对于一些小的组织如小鼠的脾、肾等器官则可以整个取出浸入溶液中,较大的则应切开为厚度小于0.5公分的小块,以确保RNAlater 能迅速扩散渗透入组织块中的所有细胞中。采样的容器应该足够大以容纳10倍于组织重量的溶液,避免组织块挤在一起,同时建议将溶液加满容器以避免在运输过程中组织块露出液面。
RNAlater还可以直接加入到离心收集的细胞团甚至加入正在培养的细胞中。保存后的样品可以直接用于RNA或者mRNA的抽提。RNAlater不会影响组织块的结构,可以在室温下切出适量的组织块用于称量和抽提RNA,剩下的部分可用于继续保存样品。-20度冻存的样品可以取出在室温下进行称量等操作而无需干冰。在-20度冻存的样品反复冻融20次RNA依然保持完好无损。RNAlater处理过的样品比新鲜组织稍微硬一点,但不会影响RNA纯化过程。待要抽提RNA时只要将组织块取出直接加裂解Buffer、或者研磨、或者匀浆化,或者冻融处理就行,就像新鲜组织一样,而不用担心RNase,因为它们已经失活了。即使是脾脏这样RNase含量极为丰富、通常很难提到完整RNA的组织也能得到很好的结果。
很重要的一点是,RNAlater可以配合各种常见的RNA抽提试剂盒使用,例如QIAGEN的RNeasy系列、LTI/GIBCO的TRIzol、Ambion的RNAwiz、RNAzol、TRI以及利用Oligo(dT)原理的mRNA抽提试剂盒,还有酚抽法。有些用户说RNAlater甚至可以加入裂解液中而不影响结果。
RNAlater适用于各种哺乳动物组织、植物、爪蟾、鱼类、果蝇、大肠杆菌和培养细胞。注意:本试剂只适用于新鲜样品,对于已经冷藏和包埋的样品直接抽提RNA即可。另外对于RNA已经降解的样品,RNAlater只能保护剩下的样品RNA,不能修复已破坏的RNA。本试剂也不适用于全血或体液中RNA的保存,全血样本请参见PAXGENE system。RNAlater TissueProtect Tubes是预先分装好RNAlater试剂的保存管,使用更加简单。RNeasy Protect Kit则提供一整套RNA保护和分离试剂,从样品的保存到RNA的抽提,只需一个试剂盒即可解决所有问题。保证样品的表达信息不受破坏,确保得到可信的基因表达分析结果。
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推荐理由:
· 快速有效地将RNA固定保存在生物样本中,为基因表达分析等后续工作提供可靠的原材料
· 无需液氮或干冰,方便安全地在室温下保存样本,低温可长期保存
· 低温保存时即使反复冻融也不会导致RNA降解
· 进行后续操作只需从保存液中将样本取出即可
· 对细菌样本有专用的RNAprotect Bacteria Reagent
· 可单独选购RNAlater,也可购买完整RNAprotect试剂盒,包含RNAlater和纯化试剂
保存在RNAlater中的样品RNA可以:
· 37℃下稳定保存1天
· 18-25℃保存7天
· 2-8℃稳定4周
· -20℃永久保存
-Immediate RNA stabilization and protection in biological samples to ensure reliable gene-expression and gene-profiling data
-Convenient and safe handling with innovative RNAlater™ stabilization at room temperature — no need for liquid nitrogen or dry ice
-Archived biological samples can go through multiple freeze–thaw cycles without risk of RNA degradation
-Easy, fast, and reliable RNA isolation — ready-to-use RNA for all downstream applications