细菌基因组数据的积累让微生物学家发现了单一菌株的基因组信息并不能完整地表述一个菌种的全部遗传信息和生物学特性。
为了更全面地在基因组水平上揭示细菌种内个体间的遗传多样性,进一步探寻个体间的系统发生关系和个体间表型差异的遗传基础,为基因功能分析、微生物的环境适应性、病原菌的致病和耐药机制研究提供丰富的理论与数据支持,比较基因组学逐渐成为研究者们对细菌基因组研究领域关注的重点之一。
然而,在对细菌基因组研究过程中,难免遇到各种各样的“坑”,为解决大家在研究过程中的实际问题,华大基因学院特开设《细菌比较基因组分析实战培训班》。
本期讲师团队长期从事细菌基因组学数据分析工作,在组学领域积累了丰富的项目经验和教学经验,讲师们将把华大在细菌基因组研究分析中宝贵的前沿技术&经验分享给各位同仁。
课程说明:自备电脑,推荐使用Mac或linux操作系统的笔记本电脑!CPU 2G以上,内存4G以上,电脑请自备连接有线网络的端口。
主办单位:深圳市华大基因学院
举办地点:中国 • 深圳 ——深圳市华大基因学院
培训时间:2020年2月20日-2月24日(5天)
培训对象:
- 正在从事相关领域研究的科研工作者和高校师生
- 对此方向感兴趣或有计划从事本领域研究,希望通过集中专题学习扩展思路,将该技术应用于自己项目的
研究人员
培训目标:
帮助学员学习掌握:
- 细菌基因组学的科学研究思路、项目设计方法
- 细菌基因组测序的基础分析方法以及个性化数据分析思路
- 微生物组学研究常见图形绘制技巧
培训优势:
- 一流的讲师——丰富的科研经验、重大项目执行经验
- 全面的课程——技术原理、分析流程&技术应用相互结合
- 高效的方法——经过大量实际项目验证的有效分析方法与流程
- 面对面解决问题——与信息分析、数据挖掘达人面对面探讨项目中的瓶颈问题
三、课程内容
面授课程 紧扣临床实践需要,与专家面对面探讨新技术在临床应用中遇到的问题
日期 |
时间 |
课程 |
形式 |
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预习资料:
《新一代测序技术原理》-112mins
《Linux 操作系统基础 》-40mins |
视频自学 |
第一天 |
9:00-12:00 |
1.细菌基因组学研究趋势和方法介绍 |
理论 |
2.基因组进化和功能、表型关联分析方法 |
3.经典文献解读(经典综述与经典研究文章) |
14:00-17:30 |
4.生信分析基础技能理论与操作训练
4.1 大型机操作/Linux及编程基础 |
理论+实操 |
第二天 |
9:00-12:00 |
4.2 生信分析软件介绍、安装与依赖环境搭建 |
理论+实操 |
14:00-17:30 |
5.细菌基因组基础分析与实操
5.1 单菌基因组高通量测序数据特征、质控和预处理 |
理论+实操 |
第三天 |
9:00-12:00 |
5.2细菌基因组组装 |
理论+实操 |
14:00-17:30 |
5.3细菌基因组基因预测、注释和功能分析 |
理论+实操 |
第四天 |
9:00-12:00 |
6.细菌比较基因组分析
6.1多基因组泛基因组和和核心基因分析 |
理论+实操 |
14:00-17:30 |
6.2细菌基因组进化分析方法 |
理论+实操 |
第五天 |
9:00-12:00 |
7.细菌基因组高级绘图:基因组圈图、特定基因簇编码结构绘图方法 |
理论+实操 |
14:00-17:30 |
深圳国家基因库参观 |
【注】:华大基因学院保留对以上课程进行调整的权利,具体课程信息以实际上课为准。
五、部分讲师团队
李 力 强 博士 生物技术副研究员
Evolution Application,Evolutionary Bioinformatics,Plos One等期刊审稿人;深圳市科技创新委员会科技专家
浙江大学病原微生物方向博士毕业,2013年入职华大研究院,有丰富的微生物基因组学研究经验。负责研究涉及沙门氏菌、布鲁氏菌、分支杆菌等多种细菌感染性病原;流感病毒、手足口病、乙肝病毒、寨卡病毒等病毒性感染病;从新病原鉴定、比较基因组学、基因组进化和流行病学等多个领域。主持或参与国家省市级项目8项,国家级项目3项,市级项目5项,累计获批资助经费400多万元。累计已发表科研论文16篇,其中SCI 14篇,8篇一作或通讯作者论文;参编学术专著2部。
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王 爽 微生物产品线信息分析负责人 华大基因高级信息分析工程师
2010年入职华大。主要负责单菌产品及Meta产品,擅长微生物基因组组装,注释及比较基因组分析,以及数据解读及挖掘。负责搭建细菌完成图及比较基因组分析流程。参与执行多项微生物大项目,包括德国40个粘细菌de novo测序(粘细菌-myxobacteria),东北农业大学10株乳酸菌完成图测序等。
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六、收 费 标 准
注 册 费5600元/人 含学费、资料费、实操练习费、其他材料费及餐费 培训期间可协助安排住宿,住宿费用自理
优 惠 政 策:
华大培训及业务合作老客户,可享受9.5折,即:5320元/人;
转发分享此文到朋友圈报名,可享受9折,即:5040元/人;
参加过本期培训预报名的学员,5100元/人;
团体报名(5人及以上),可享8折,即:4480元/人;
注:以上优惠不能同时使用,最终解释权归华大学院所有
七、报名方式: 线上报名 扫描以下二维码,填写报名信息,提交并支付,即可报名成功。
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