“SBC circRNA array V1.0”

环状RNA芯片带您畅游“隐秘而未知的RNA平行宇宙”—环状RNA的海洋

环状RNA简介 ：

      环状RNA（Circular RNA，circRNA）不同于经典生物学认识的线性RNA分子，是一大类具有闭合环状结构的特殊非编码RNA。环状RNA大量存在于真核细胞中，通常具有组织或发育阶段的表达特异性，且多数序列高度保守，是扮演重要调控作用的新明星分子。circRNA由于呈闭合环状结构，不受RNA外切酶影响，表达更稳定，不易降解。这使得环状RNA在作为新型临床诊断标记物的开发应用上具有明显优势。

      近年的研究表明circRNA分子富含microRNA结合位点，在细胞中起到miRNA海绵（miRNA sponge）的作用，进而解除miRNA对其靶基因的抑制作用，升高靶基因的表达水平，这一作用机制被称为竞争性内源RNA（ceRNA）机制。因此，通过与疾病关联的miRNA相互作用，circRNA在疾病中发挥着重要的调控作用。circRNA在基因表达调控中重要作用的发现不仅丰富了人们对ceRNA调控网络的认识，而且提示circRNA在药物开发和疾病诊治中具有良好的应用前景。

• 芯片覆盖circRNA、lncRNA、mRNA。一份芯片数据同时提供三个层面的表达信息，circRNA和lncRNA都可作为竞争性内源RNA，此款芯片可以让您畅游ceRNA调控研究。
• circRNA所有探针设计基于最新最全的国际主流circRNA数据库信息。
•  环状RNA -特异的反向剪接位点探针设计，保证每个探针检测的特异性，避免与母基因之间的冗余影响。

•  lncRNA及mRNA-探针设计基于最新基因组版本（human/GRCh38(hg38)），涵盖GENCODE V21、Ensembl 、UCSC、NONCODE、LNCipedia、lncRNAdb等核心lncRNA数据库；生物信息专家对来自上述数据库的全部lncRNA序列进行序列比对，去冗余，并对精简后的lncRNA序列设计特异探针，尤其对于有部分重叠序列的lncRNA与mRNA 进行了很好的处理。

芯片参数：

                   环状RNA数目：88371
                   数据库来源: Circbase
                   探针长度：60 nt

数据分析流程：

环状RNA与miRNA互作图：

mRNA功能分析：