梁晗：从癌症基因组中寻找性别差异

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如果有一种软件能告诉你今后患上癌症的可能性是多少，而其中判断的因素之一就是你的性别是男还是女，你会相信吗？可能大部分人都会摇头：怎么可能性别影响如此之大。但越来越多的研究表明，性别在癌症中起着不可忽视的作用。

来自美国德州大学MD安德森癌症中心的一项研究通过调查13种癌症类型，在分子水平上认识了性别对不同癌症的影响，这也就是说我们可能迫切需要开发出性别特异性的治疗策略。这一研究成果发表在Cancer Cell杂志上，为了更深入了解这项成果，生物通特联系了领导这一研究的MD安德森癌症中心生物信息学和计算生物学副教授梁晗（Han Liang），就读者感兴趣的问题请教了他……【详细全文】

■ 癌症的个体差异

在很多人看来，我和他所患的是同一种癌症，为何需要区别对待呢？现代生物学告诉我们，癌症具有显著的个体差异，是多因素、多个信号传导通路作用的结果，具有高度异质性，其发生、发展过程中涉及DNA水平、转录、转录后修饰及蛋白水平的多种变化，最终导致正常细胞发生表型转化，而这也是导致其恶性生长、远处转移、治疗反应等各异的主要因素。【详细全文】

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■ 癌症的性别差异：

在各种个体差异中，性别差异是最有趣的研究话题之一，曾经有调查指出，近年来癌症的发病率急速飙升，而其中男性患癌几率要高于女性，但这些调查都是从表面现象进行分析，未能指出其背后的分子机制。

来自MD安德森癌症中心的梁晗等人利用来自癌症基因组图谱（TCGA）的数据，发现一半以上经研究与癌症治疗临床实践有关联的基因，在某些癌症类型中显示出性别偏倚标记。

“我们研究组这几年来一直致力于癌症基因组的比较分析，尤其是跨癌症类型的比较。而这些分析的主要目的是为理解肿瘤的分子基础，从而为精准癌症治疗提供有益的思路。随着TCGA项目的不断深入，我们发现目前的分子比较局限于癌症亚型之间。而男女性别的差异在很多种癌症的发病率，死亡率，和治疗效果都有很大的差异（甚至大于一些亚型的差异），而两者之间的分子差异的研究却少之又少，所以很自然的确立了这样一个课题，”梁晗博士指出。【详细全文】

■ 性别差异的影响到底有多大？

梁晗研究小组在患者群体中针对膀胱癌、结肠癌、肾癌、脑癌、直肠癌、甲状腺癌、肝癌、肺脏和急性髓性白血病等各种癌症分性别分析了30个或以上的样本的数据。他们寻找了包括体细胞突变、拷贝变异、蛋白质和基因表达及DNA甲基化在内的特殊分子数据。

“从中我们发现男女病人的差异在不同癌症类型中有很大不同：有一些癌症，在各种分子分析中有差异的基因很少（几十个），我们把这类癌症类型就叫做性别弱效力组；而另一些癌症，在各种分子分析中有差异的基因很多（几千个），我们把这类癌症类型叫做性别强效力组，”梁晗博士解释道。【详细全文】

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■ 更多的意义

这项研究在分子层面上对不同癌症类型男女患者的差别进行了全面的梳理，对癌症类型进行了分类。“对弱效力的癌症类型，对于性别差异对待可能意义不大；而对于强效力的癌症类型，对不同性别就应该有特别考虑。特别是当所用药物的靶点分子有很大性别差异，就要特别考虑。从这个意义讲，我们的工作对以性别为基础的癌症精准治疗提供了理论依据，明确了临床实施中的考虑重点和探索方向”，梁晗博士说。

下一步，梁晗研究组还将进行更进一步的研究，如与年龄，种群等有关的其它差异因素。目前别的研究组也已经发表了年龄对癌症病人分子影响相关的一些文章。
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人物简介：

Dr. Liang received Ph.D. training from the Quantitative and Computational Biology program (home department, Chemistry) at Princeton University, which provides graduate education in the interface of biology, the physical sciences, and computational science. His PhD thesis is about RNA informatics on translation termination and alternative splicing. As a postdoctoral researcher, Dr. Liang completed three years of research on computational and evolutionary genomics at the University of Chicago, where his research was about microRNA regulation and gene duplication. Currently, Dr. Liang's research interests include development of bioinformatics tools for better analyzing cancer genomic data, the pan-cancer genomic analysis, RNA editing, and the evolutionary process of cancer cells.