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  研究成果 人物简介  

■ 导语:肝癌是一种严重威胁人们健康的恶性肿瘤,素有“癌王”之称,据估计全世界每年新发现肝癌大约为100万左右,在常见肿瘤中排名第五(占恶性肿瘤5%左右),其中40%发生在中国。


专访黄健博士:大规模肝癌外显子测序研究
       近期由韩泽广、黄健等人领导的上海交大医学院附属瑞金医院和国家人类基因组南方研究中心等处的研究组利用先进的外显子组测序技术对乙型肝炎病毒相关的肝癌开展了大规模的测序和分析研究。

       这一研究为我们提供了可能与中晚期肝癌相关的体细胞突变的图谱,并为人们发现有关驱动肝癌发生及生长分子途径提供了重要的线索。

       日前生物通有幸联系到了黄健博士,就该项重要研究的相关内容请教了本人。
 


◆问答内容:


请问你们的研究为什么会选择肝细胞癌,特别是肝内转移性肝细胞癌作为研究对象?
【答】肝细胞癌(Hepatocellular Carcinoma, HCC)是原发性肝癌(Primary Liver Cancer)的主要形式,也是世界上发病率最高的恶性肿瘤之一……

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能否简略谈下课题的研究思路,有何重要发现?这些发现的意义是什么?
【答】我们知道,转移发生率与肝癌的生物学特性密切有关,特别是肝癌细胞内促转移基因和抑癌基因的平衡失调在肝癌转移中起到重要作用……

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你们研究的目的是筛选乙型肝癌特异的突变基因。基因芯片同样是高通量的技术手段,为何不选用基因芯片,而选用高通量测序技术呢?
【答】基因芯片和基因测序是目前主要的高通量基因组学筛选工具。基因芯片操作简单,数据分析便捷,但是基因芯片上的探针是已知序列,只能检测已知序列的基因变异……

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你们的研究中为何要同时选用Illumina/Solexa sequencing和ABI SOLiD sequencing这两个相似的技术平台呢?此外,众所周知高通量测序技术面临的一个问题就是数据分析,您在这项研究中是否也遇到了这个问题?您是如何解决的?
【答】目前,国际上常用的高通量测序技术有Illumina公司的Solexa系统、ABI公司的 SOLiD系统以及Roche公司的454系统。前二种所获得的序列较短,但序列的数量比较多,而454系统虽然序列比较长……

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人物简介:


黄健博士,研究员
生物芯片上海国家工程中心肿瘤基因组学转化应用研究室主任

研究方向是肿瘤基因组学和分子遗传学:利用基因芯片和高通量测序技术及生物信息学手段,系统分析肿瘤(肝癌)基因组、转录组和甲基化组的变异,并探讨各种变异与临床特征的关联性,结合细胞学和动物学技术识别鉴定与肿瘤相关的重要功能基因,深入研究其在肿瘤发生发展中的分子机制,为肿瘤的临床诊断提供新的指标,或为最终治愈肿瘤提供潜在的药物靶点。

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

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